More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4514 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 3689 aa  7488    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.27 
 
 		 2096 aa  400  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0056  hypothetical protein  31.14 
 
 		 1750 aa  374  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.93 
 
 		 3027 aa  370  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.72 
 
 		 1271 aa  327  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.98 
 
 		 2149 aa  317  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 2035 aa  284  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.18 
 
 		 2277 aa  283  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1959 aa  276  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.26 
 
 		 1352 aa  254  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1840 aa  253  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  27.05 
 
 		 1559 aa  238  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1942 aa  233  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1669 aa  231  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.29 
 
 		 1953 aa  228  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1917 aa  228  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.25 
 
 		 2731 aa  227  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 3273 aa  221  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.84 
 
 		 1485 aa  211  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  27.43 
 
 		 6272 aa  204  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 1600 aa  194  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3992  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1055 aa  193  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00061561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.34 
 
 		 1434 aa  186  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.41 
 
 		 1626 aa  182  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1547 aa  175  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1550 aa  174  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.75 
 
 		 1489 aa  173  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 3073 aa  173  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  51.2 
 
 		 6274 aa  173  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1620 aa  173  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27 
 
 		 1467 aa  171  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1520 aa  171  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.35 
 
 		 1560 aa  171  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 2942 aa  167  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.37 
 
 		 1259 aa  165  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.31 
 
 		 1576 aa  164  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1527 aa  164  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.15 
 
 		 1485 aa  163  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.6 
 
 		 1572 aa  158  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1541 aa  157  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.93 
 
 		 1981 aa  157  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1541 aa  155  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1541 aa  155  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  23.52 
 
 		 5189 aa  155  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  23.52 
 
 		 5236 aa  155  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1602 aa  154  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25 
 
 		 1518 aa  154  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.98 
 
 		 1509 aa  153  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1197 aa  153  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1531 aa  153  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1595 aa  152  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.05 
 
 		 1568 aa  152  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  25.52 
 
 		 1543 aa  152  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1586 aa  152  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.75 
 
 		 1488 aa  152  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1390 aa  150  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1551 aa  150  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.32 
 
 		 1579 aa  148  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  25.8 
 
 		 1593 aa  148  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.32 
 
 		 1428 aa  148  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  22.72 
 
 		 1417 aa  147  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  23.43 
 
 		 1410 aa  147  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.7 
 
 		 1429 aa  145  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.15 
 
 		 1508 aa  144  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1552 aa  144  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.9 
 
 		 1528 aa  142  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  27.2 
 
 		 1528 aa  142  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.4 
 
 		 1446 aa  142  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1565 aa  140  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1565 aa  140  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1586 aa  140  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.23 
 
 		 1495 aa  140  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1541 aa  140  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1541 aa  140  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1541 aa  140  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1611 aa  140  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.09 
 
 		 1614 aa  139  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  24.4 
 
 		 2144 aa  139  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  25.8 
 
 		 1447 aa  138  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1381 aa  138  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  22.99 
 
 		 1405 aa  137  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.45 
 
 		 2225 aa  136  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.45 
 
 		 1609 aa  135  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.33 
 
 		 1379 aa  135  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.76 
 
 		 1539 aa  135  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1554 aa  136  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 6109 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  23.84 
 
 		 1673 aa  133  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 2374 aa  134  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.82 
 
 		 1362 aa  133  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.62 
 
 		 1539 aa  130  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.55 
 
 		 1517 aa  129  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.88 
 
 		 678 aa  129  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  23.16 
 
 		 1388 aa  129  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  25.81 
 
 		 613 aa  129  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  22.99 
 
 		 1388 aa  129  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  22.96 
 
 		 1639 aa  129  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  22.86 
 
 		 1308 aa  128  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1505 aa  128  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1386 aa  128  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>