More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_B2808 on replicon NC_007615
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  45.98 
 
 		 1558 aa  1172    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  45.87 
 
 		 1368 aa  894    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  41.91 
 
 		 1681 aa  1131    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  44.2 
 
 		 1710 aa  1252    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 		 1599 aa  3308    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  29.4 
 
 		 1464 aa  341  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.7 
 
 		 2096 aa  256  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.74 
 
 		 1271 aa  249  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1600 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1352 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.25 
 
 		 2149 aa  230  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1531 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.51 
 
 		 1008 aa  202  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.51 
 
 		 1008 aa  202  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.87 
 
 		 1467 aa  196  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.76 
 
 		 2277 aa  194  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1611 aa  192  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1419 aa  192  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.25 
 
 		 1345 aa  192  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  27.25 
 
 		 1345 aa  192  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 3193 aa  189  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.5 
 
 		 1485 aa  188  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1550 aa  186  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.64 
 
 		 1576 aa  185  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.97 
 
 		 1568 aa  182  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1520 aa  181  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.59 
 
 		 3027 aa  179  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.95 
 
 		 1381 aa  178  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1554 aa  176  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.86 
 
 		 1485 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 867 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.68 
 
 		 1379 aa  174  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1547 aa  174  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1390 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  25.43 
 
 		 1160 aa  172  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.14 
 
 		 1614 aa  172  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.82 
 
 		 1953 aa  171  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.34 
 
 		 1385 aa  171  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.45 
 
 		 1595 aa  171  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.54 
 
 		 1577 aa  170  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.45 
 
 		 1586 aa  169  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 2035 aa  169  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.55 
 
 		 1572 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.89 
 
 		 2003 aa  167  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.43 
 
 		 1530 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.56 
 
 		 1384 aa  166  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1488 aa  166  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.45 
 
 		 1348 aa  166  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 2831 aa  166  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1147 aa  164  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 927 aa  164  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  26.13 
 
 		 924 aa  164  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1527 aa  163  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1834 aa  163  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1400 aa  164  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 2961 aa  164  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.65 
 
 		 903 aa  164  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.19 
 
 		 1489 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1541 aa  162  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1541 aa  162  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1541 aa  162  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1409 aa  162  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1541 aa  162  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1541 aa  161  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1189 aa  161  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1527 aa  160  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  45.64 
 
 		 335 aa  160  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1551 aa  160  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1433 aa  160  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1411 aa  159  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.86 
 
 		 1509 aa  158  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1541 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.28 
 
 		 1560 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  26.45 
 
 		 2178 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.18 
 
 		 1517 aa  156  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  24.68 
 
 		 1912 aa  154  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.11 
 
 		 690 aa  154  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1602 aa  154  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  24.1 
 
 		 1421 aa  153  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1386 aa  152  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.66 
 
 		 1429 aa  152  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  24.73 
 
 		 1929 aa  152  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.22 
 
 		 1609 aa  152  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 913 aa  152  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  25.06 
 
 		 1446 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25 
 
 		 1679 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  27.43 
 
 		 2224 aa  151  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 866 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1586 aa  150  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.03 
 
 		 2225 aa  149  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  27.12 
 
 		 2221 aa  149  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1381 aa  147  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.94 
 
 		 1197 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.52 
 
 		 1732 aa  148  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 3073 aa  147  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.94 
 
 		 1518 aa  147  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.74 
 
 		 1673 aa  147  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.22 
 
 		 2246 aa  146  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1149 aa  146  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1418 aa  146  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>