More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1434 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  79.63 
 
 		 1541 aa  2236    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  79.85 
 
 		 1541 aa  2246    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  79.78 
 
 		 1541 aa  2242    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  35.08 
 
 		 1517 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  79.78 
 
 		 1541 aa  2242    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  77.45 
 
 		 1381 aa  2001    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  79.78 
 
 		 1541 aa  2242    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1553 aa  3174    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  79.78 
 
 		 1541 aa  2242    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  34.11 
 
 		 1495 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  35.11 
 
 		 1494 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  35.11 
 
 		 1494 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1487 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.88 
 
 		 1527 aa  519  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1189 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  30.98 
 
 		 1259 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  31.13 
 
 		 1485 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1699 aa  429  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  31.11 
 
 		 1679 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.93 
 
 		 1509 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  31.29 
 
 		 1488 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  30.04 
 
 		 1639 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  31.47 
 
 		 1673 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  29.23 
 
 		 1475 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  28.86 
 
 		 1518 aa  383  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  27.83 
 
 		 1447 aa  384  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1197 aa  380  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.68 
 
 		 1528 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  28.35 
 
 		 1489 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  27.92 
 
 		 1422 aa  373  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  27.79 
 
 		 1428 aa  369  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  29.06 
 
 		 1457 aa  365  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  28.69 
 
 		 1437 aa  365  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1505 aa  363  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  28.49 
 
 		 1423 aa  363  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  29.78 
 
 		 1495 aa  358  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1600 aa  356  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  28.16 
 
 		 1528 aa  345  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  29.1 
 
 		 1616 aa  344  9e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  26.64 
 
 		 1508 aa  307  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.14 
 
 		 1576 aa  296  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.36 
 
 		 1446 aa  295  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  26.64 
 
 		 1421 aa  294  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1409 aa  291  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1402 aa  290  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.87 
 
 		 1385 aa  290  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1390 aa  289  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1418 aa  288  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1400 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  26.59 
 
 		 1359 aa  285  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1466 aa  276  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1547 aa  275  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1586 aa  272  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1419 aa  271  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.82 
 
 		 2144 aa  271  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1492 aa  271  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  29.42 
 
 		 931 aa  270  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1531 aa  270  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1386 aa  270  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1520 aa  270  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1410 aa  269  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1550 aa  268  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.69 
 
 		 1379 aa  266  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.12 
 
 		 1614 aa  265  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1611 aa  265  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.8 
 
 		 1568 aa  260  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1551 aa  259  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1527 aa  258  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.19 
 
 		 1560 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.75 
 
 		 2096 aa  254  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1411 aa  254  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.15 
 
 		 1429 aa  251  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.56 
 
 		 1595 aa  251  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1586 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.51 
 
 		 1434 aa  249  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.76 
 
 		 1572 aa  248  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  26.09 
 
 		 1981 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.74 
 
 		 1609 aa  244  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1229 aa  239  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.01 
 
 		 1543 aa  238  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1552 aa  236  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.36 
 
 		 1348 aa  234  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1620 aa  232  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.53 
 
 		 1530 aa  232  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.18 
 
 		 1362 aa  232  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.19 
 
 		 1573 aa  227  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.69 
 
 		 1539 aa  227  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1554 aa  226  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.19 
 
 		 1539 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1602 aa  222  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  27.39 
 
 		 924 aa  221  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  26.95 
 
 		 1579 aa  218  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.64 
 
 		 1626 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  26.88 
 
 		 1428 aa  214  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1352 aa  214  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 2035 aa  213  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1600 aa  204  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1368 aa  204  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1604 aa  200  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.31 
 
 		 2149 aa  193  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>