More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4805 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  36.31 
 
 		 1390 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  68.35 
 
 		 1400 aa  1758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  68.52 
 
 		 1385 aa  1762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  67.15 
 
 		 1386 aa  1695    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  68.16 
 
 		 1411 aa  1748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  41.53 
 
 		 1410 aa  891    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  89.71 
 
 		 855 aa  1570    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  72.14 
 
 		 1140 aa  1644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  36.16 
 
 		 1418 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1229 aa  2542    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  76.2 
 
 		 1409 aa  1969    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  82.75 
 
 		 867 aa  1202    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  84.71 
 
 		 555 aa  969    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1419 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.11 
 
 		 1446 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  70.14 
 
 		 866 aa  1031    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  70.22 
 
 		 497 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  35.69 
 
 		 1421 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  37.3 
 
 		 1359 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  36.31 
 
 		 1402 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  34.55 
 
 		 1379 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  66.83 
 
 		 561 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  33.72 
 
 		 1583 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  33.41 
 
 		 1604 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  87.62 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1531 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  33.23 
 
 		 1530 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1654 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  33.88 
 
 		 1568 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  87.8 
 
 		 451 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  32.94 
 
 		 1348 aa  459  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.41 
 
 		 1362 aa  459  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  31.73 
 
 		 1586 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  29.14 
 
 		 1150 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1150 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  29.13 
 
 		 1150 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  29.19 
 
 		 1150 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  31.84 
 
 		 1149 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  31.59 
 
 		 1149 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1602 aa  403  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1554 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2528  YD repeat-containing protein  65.4 
 
 		 283 aa  393  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1520 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  35.5 
 
 		 924 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1547 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  29.8 
 
 		 1527 aa  376  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1550 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1551 aa  373  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.66 
 
 		 1609 aa  351  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.81 
 
 		 1981 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.51 
 
 		 1560 aa  336  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.78 
 
 		 1626 aa  335  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  28.62 
 
 		 1429 aa  333  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1620 aa  331  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.22 
 
 		 1573 aa  324  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.32 
 
 		 1576 aa  318  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.86 
 
 		 1572 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  29.35 
 
 		 1614 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1611 aa  297  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.91 
 
 		 1595 aa  294  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.88 
 
 		 1586 aa  293  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1487 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1317 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1319 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  28.18 
 
 		 1410 aa  270  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1197 aa  266  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  28.57 
 
 		 1415 aa  263  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  28.2 
 
 		 1417 aa  264  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  28.05 
 
 		 1388 aa  263  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.74 
 
 		 1434 aa  255  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4994  rhs-related protein  83.94 
 
 		 137 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.1 
 
 		 1488 aa  248  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1509 aa  248  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1405 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  26.22 
 
 		 1579 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.06 
 
 		 1489 aa  238  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.06 
 
 		 1517 aa  237  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.91 
 
 		 1485 aa  237  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1411 aa  237  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1600 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1525 aa  236  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  26.07 
 
 		 1428 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1528 aa  236  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1509 aa  235  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1397 aa  235  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1505 aa  233  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  232  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1541 aa  232  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1541 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1541 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1541 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1381 aa  231  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1268 aa  230  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26 
 
 		 1528 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  27.22 
 
 		 1397 aa  229  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  29.12 
 
 		 1405 aa  228  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  24.62 
 
 		 1616 aa  226  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.79 
 
 		 1508 aa  226  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  28.81 
 
 		 1400 aa  225  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>