More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1472 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1600 aa  3271    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  42.99 
 
 		 1352 aa  755    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  32.8 
 
 		 2096 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  34.75 
 
 		 1271 aa  416  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  28.83 
 
 		 2149 aa  357  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  28.02 
 
 		 2277 aa  298  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.21 
 
 		 1485 aa  295  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 2035 aa  293  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.32 
 
 		 3027 aa  285  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  30.13 
 
 		 1008 aa  282  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  30.13 
 
 		 1008 aa  282  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  28.42 
 
 		 2731 aa  281  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.08 
 
 		 1488 aa  281  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  30.02 
 
 		 1345 aa  280  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  30.02 
 
 		 1345 aa  280  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1197 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  28.31 
 
 		 1467 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  32.48 
 
 		 2294 aa  273  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1551 aa  272  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1547 aa  271  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1550 aa  269  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1527 aa  268  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1520 aa  268  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  28.66 
 
 		 1599 aa  267  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1953 aa  266  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.45 
 
 		 1485 aa  265  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.23 
 
 		 1572 aa  264  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.66 
 
 		 1560 aa  261  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  28.36 
 
 		 1681 aa  258  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.17 
 
 		 1147 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  29.64 
 
 		 1160 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.55 
 
 		 1259 aa  256  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.51 
 
 		 1626 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.45 
 
 		 1614 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1554 aa  255  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.63 
 
 		 1434 aa  254  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.25 
 
 		 1348 aa  254  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1487 aa  254  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1531 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1586 aa  251  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1942 aa  250  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  24.62 
 
 		 1539 aa  250  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  28.44 
 
 		 1381 aa  250  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.57 
 
 		 1576 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.84 
 
 		 1489 aa  246  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1611 aa  245  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.31 
 
 		 1543 aa  243  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  27.72 
 
 		 1464 aa  243  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.49 
 
 		 1509 aa  243  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1917 aa  242  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1669 aa  242  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  24.44 
 
 		 1539 aa  241  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1552 aa  241  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.71 
 
 		 1981 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1673 aa  239  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1418 aa  239  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1541 aa  239  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  28.17 
 
 		 3689 aa  238  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.31 
 
 		 1586 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  26.31 
 
 		 1639 aa  236  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  27.87 
 
 		 1494 aa  236  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1494 aa  236  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.17 
 
 		 1595 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1541 aa  235  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  27.21 
 
 		 1528 aa  235  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1840 aa  234  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  27.68 
 
 		 1998 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1390 aa  234  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1495 aa  234  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.61 
 
 		 3193 aa  234  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  30.5 
 
 		 2003 aa  234  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1402 aa  233  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.29 
 
 		 1568 aa  233  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1390 aa  232  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.27 
 
 		 1579 aa  231  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.27 
 
 		 1428 aa  231  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.81 
 
 		 1517 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1620 aa  228  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  26.63 
 
 		 2144 aa  227  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.07 
 
 		 1362 aa  228  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  25.83 
 
 		 1573 aa  226  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.26 
 
 		 1609 aa  226  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.61 
 
 		 1679 aa  226  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1381 aa  226  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1433 aa  226  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1541 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1541 aa  224  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1541 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1541 aa  224  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  27.99 
 
 		 1528 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.71 
 
 		 1429 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1553 aa  223  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1409 aa  222  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1602 aa  221  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1959 aa  221  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  28.03 
 
 		 840 aa  220  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1492 aa  220  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.99 
 
 		 924 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1466 aa  217  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.78 
 
 		 1446 aa  212  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>