More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1475 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2294 aa  4639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1352 aa  304  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1476  hypothetical protein  70.37 
 
 		 272 aa  303  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.614774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  29.06 
 
 		 2096 aa  302  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  31.03 
 
 		 1600 aa  282  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  28.88 
 
 		 1998 aa  275  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  31.88 
 
 		 1271 aa  273  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.69 
 
 		 3193 aa  271  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  29.01 
 
 		 2003 aa  237  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  29.28 
 
 		 1485 aa  215  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 2035 aa  209  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.91 
 
 		 3027 aa  204  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1942 aa  202  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.67 
 
 		 2149 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  27.69 
 
 		 1464 aa  201  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1669 aa  196  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  28.13 
 
 		 1147 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1917 aa  193  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1959 aa  192  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.75 
 
 		 1345 aa  191  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.75 
 
 		 1345 aa  191  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1840 aa  191  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  29.54 
 
 		 1008 aa  185  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  29.54 
 
 		 1008 aa  185  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.25 
 
 		 1381 aa  181  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.19 
 
 		 2277 aa  176  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 3073 aa  171  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  27.96 
 
 		 1160 aa  169  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.08 
 
 		 1467 aa  166  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.26 
 
 		 2731 aa  165  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  29.43 
 
 		 927 aa  165  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23 
 
 		 1586 aa  164  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.03 
 
 		 1595 aa  163  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1520 aa  162  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.94 
 
 		 1568 aa  161  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1611 aa  160  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.75 
 
 		 1560 aa  159  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.02 
 
 		 678 aa  159  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1433 aa  159  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.36 
 
 		 690 aa  157  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.67 
 
 		 1576 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  23.36 
 
 		 1428 aa  155  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  23.36 
 
 		 1579 aa  154  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.64 
 
 		 2658 aa  153  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.03 
 
 		 924 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1550 aa  149  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.22 
 
 		 1488 aa  149  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  26.92 
 
 		 2225 aa  149  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1602 aa  149  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  28.47 
 
 		 2349 aa  149  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.18 
 
 		 1362 aa  148  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  29 
 
 		 869 aa  147  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1197 aa  147  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1527 aa  148  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.56 
 
 		 1551 aa  146  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  27.9 
 
 		 788 aa  145  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  27.9 
 
 		 788 aa  145  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1411 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  28.3 
 
 		 1427 aa  145  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.63 
 
 		 1547 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.14 
 
 		 1385 aa  144  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  25.84 
 
 		 765 aa  142  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  28.05 
 
 		 741 aa  142  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.69 
 
 		 1572 aa  142  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1531 aa  142  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.18 
 
 		 1732 aa  140  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1046 aa  139  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1517 aa  139  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.73 
 
 		 1599 aa  139  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  20.4 
 
 		 1384 aa  138  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.45 
 
 		 1953 aa  138  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  26.17 
 
 		 1348 aa  138  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.42 
 
 		 1485 aa  137  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.5 
 
 		 903 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.87 
 
 		 2178 aa  137  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.51 
 
 		 1614 aa  135  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.78 
 
 		 1981 aa  135  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  27.26 
 
 		 764 aa  135  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1081 aa  135  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.76 
 
 		 1434 aa  134  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.33 
 
 		 2224 aa  133  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  27.82 
 
 		 2224 aa  134  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.33 
 
 		 2224 aa  133  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.46 
 
 		 765 aa  132  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.82 
 
 		 1509 aa  132  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.92 
 
 		 2221 aa  132  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 1559 aa  132  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  26.42 
 
 		 2246 aa  132  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1400 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.13 
 
 		 1518 aa  130  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  26.22 
 
 		 902 aa  129  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  21.66 
 
 		 1609 aa  129  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  22.87 
 
 		 1626 aa  129  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  23.02 
 
 		 1593 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 866 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 3689 aa  128  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1386 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1554 aa  127  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  25.31 
 
 		 1053 aa  127  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  26.27 
 
 		 1681 aa  126  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>