More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4937 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  100 
 
 		 1998 aa  4028    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4873  YD repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1405 aa  345  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  28.82 
 
 		 2294 aa  278  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  33.04 
 
 		 869 aa  275  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1352 aa  236  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1600 aa  233  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.14 
 
 		 1271 aa  227  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.55 
 
 		 2096 aa  224  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.19 
 
 		 2035 aa  157  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.95 
 
 		 1381 aa  157  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.94 
 
 		 1467 aa  144  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.26 
 
 		 3027 aa  139  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.07 
 
 		 1485 aa  139  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.19 
 
 		 2277 aa  139  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 2003 aa  129  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.11 
 
 		 2149 aa  127  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.13 
 
 		 1464 aa  122  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.99 
 
 		 3193 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.53 
 
 		 1953 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.23 
 
 		 927 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 3689 aa  117  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.01 
 
 		 678 aa  115  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1959 aa  115  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.99 
 
 		 1599 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1917 aa  112  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1390 aa  111  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 2942 aa  111  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1147 aa  111  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1669 aa  111  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.59 
 
 		 1840 aa  111  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 3073 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.99 
 
 		 1008 aa  110  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.99 
 
 		 1008 aa  110  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.97 
 
 		 1834 aa  109  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.99 
 
 		 1345 aa  109  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.99 
 
 		 1345 aa  109  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0459  transglutaminase domain-containing protein  26.84 
 
 		 971 aa  109  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.89 
 
 		 1485 aa  108  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2571  transglutaminase domain protein  21.7 
 
 		 1559 aa  107  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0223142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25 
 
 		 1577 aa  107  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.55 
 
 		 1732 aa  106  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  22.31 
 
 		 1611 aa  105  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  25.8 
 
 		 1991 aa  105  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.21 
 
 		 1942 aa  105  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1509 aa  104  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.78 
 
 		 1488 aa  102  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.11 
 
 		 2731 aa  102  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.92 
 
 		 1528 aa  101  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.47 
 
 		 2017 aa  99.4  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  22.33 
 
 		 1259 aa  97.1  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  24.09 
 
 		 840 aa  96.3  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.3 
 
 		 1348 aa  96.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0056  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1750 aa  95.5  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1160 aa  94.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 690 aa  95.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  27.6 
 
 		 2349 aa  95.5  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 1517 aa  94.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  27.57 
 
 		 741 aa  93.6  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1565 aa  92.8  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  22.52 
 
 		 1565 aa  92.8  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.26 
 
 		 2225 aa  92.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2496  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1094 aa  92.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3992  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1055 aa  90.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00061561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 972 aa  90.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.94 
 
 		 1046 aa  90.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.88 
 
 		 1489 aa  90.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 		 913 aa  89.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  24.31 
 
 		 2138 aa  88.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.48 
 
 		 1528 aa  88.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1935 aa  88.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.92 
 
 		 1518 aa  87.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.77 
 
 		 903 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  26.59 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  26.59 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  26.6 
 
 		 705 aa  87  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.95 
 
 		 1576 aa  87  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  27.07 
 
 		 2387 aa  86.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  24.92 
 
 		 2510 aa  85.9  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  29.46 
 
 		 1710 aa  85.9  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1433 aa  85.9  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.45 
 
 		 1568 aa  85.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 3273 aa  84.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.43 
 
 		 1572 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.01 
 
 		 1531 aa  84  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1419 aa  83.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 909 aa  82.8  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1558 aa  82.8  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23 
 
 		 1386 aa  82.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.38 
 
 		 2246 aa  82.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  27.84 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 628 aa  82.4  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 2374 aa  82.4  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.26 
 
 		 1362 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  30.34 
 
 		 1681 aa  81.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.49 
 
 		 764 aa  81.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.67 
 
 		 1614 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  23.41 
 
 		 1508 aa  80.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.35 
 
 		 2224 aa  79.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.35 
 
 		 2224 aa  79.7  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>