More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7071 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  100 
 
 		 1160 aa  2351    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  65.95 
 
 		 1147 aa  1396    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  32.32 
 
 		 1345 aa  341  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  32.32 
 
 		 1345 aa  341  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  32.39 
 
 		 1008 aa  326  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  32.39 
 
 		 1008 aa  326  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1352 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1600 aa  265  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.88 
 
 		 1271 aa  220  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.85 
 
 		 2096 aa  218  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.32 
 
 		 2149 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  26.7 
 
 		 2035 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.19 
 
 		 1599 aa  183  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.72 
 
 		 2294 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.3 
 
 		 1518 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 2003 aa  171  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.1 
 
 		 3027 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1527 aa  168  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.64 
 
 		 2731 aa  167  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1551 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1959 aa  166  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1550 aa  164  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.09 
 
 		 1381 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.31 
 
 		 1560 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1520 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.57 
 
 		 2277 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.49 
 
 		 1576 aa  154  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1840 aa  154  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.51 
 
 		 1495 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  27.94 
 
 		 1732 aa  152  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1547 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.34 
 
 		 1467 aa  148  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.42 
 
 		 1917 aa  148  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.57 
 
 		 1953 aa  147  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  27.57 
 
 		 1528 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.45 
 
 		 1348 aa  144  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.61 
 
 		 1434 aa  144  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1942 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1611 aa  144  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.2 
 
 		 1586 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  27.53 
 
 		 1485 aa  141  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.15 
 
 		 1528 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.83 
 
 		 1509 aa  141  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.42 
 
 		 1508 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.62 
 
 		 1489 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 927 aa  137  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 3073 aa  136  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1409 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  26.68 
 
 		 869 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.88 
 
 		 1464 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  27.29 
 
 		 678 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 3193 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.09 
 
 		 1572 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1669 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.53 
 
 		 1568 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  28.39 
 
 		 2349 aa  131  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1558 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  27.69 
 
 		 765 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.15 
 
 		 924 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1386 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1400 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.62 
 
 		 1429 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1411 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.4 
 
 		 1595 aa  128  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  26.72 
 
 		 1053 aa  128  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03366  Rhs family protein  30.63 
 
 		 337 aa  128  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000332584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.55 
 
 		 1488 aa  127  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  33.95 
 
 		 800 aa  127  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.63 
 
 		 2658 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 913 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  25.78 
 
 		 1710 aa  125  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 1623 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1419 aa  123  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1390 aa  123  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.1 
 
 		 1421 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.46 
 
 		 1446 aa  121  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.39 
 
 		 1385 aa  121  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  26.69 
 
 		 1577 aa  121  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  29.29 
 
 		 3273 aa  121  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1554 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.11 
 
 		 1485 aa  121  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.72 
 
 		 1573 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.03 
 
 		 1626 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1531 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3488  YD repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1023 aa  119  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0275829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.72 
 
 		 2225 aa  119  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1418 aa  118  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  25 
 
 		 764 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  25.61 
 
 		 840 aa  117  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1410 aa  116  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1197 aa  116  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  27.1 
 
 		 6272 aa  116  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.69 
 
 		 1259 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 867 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1602 aa  115  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.84 
 
 		 1981 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.72 
 
 		 2224 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  25.46 
 
 		 1998 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  22.8 
 
 		 1614 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 3689 aa  113  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>