More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1946 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  93.21 
 
 		 605 aa  959    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1433 aa  2921    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  30.07 
 
 		 1467 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  29.69 
 
 		 1381 aa  364  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  34.31 
 
 		 927 aa  361  5e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  32.61 
 
 		 903 aa  338  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  34.21 
 
 		 913 aa  337  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  31.71 
 
 		 889 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  36.59 
 
 		 690 aa  288  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  27.93 
 
 		 1577 aa  281  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1198 aa  273  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  30.39 
 
 		 917 aa  270  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  29.97 
 
 		 920 aa  259  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  33.97 
 
 		 788 aa  250  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  33.97 
 
 		 788 aa  250  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  33.39 
 
 		 741 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  33.17 
 
 		 764 aa  246  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2096 aa  246  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  31.69 
 
 		 705 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1352 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1600 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1301 aa  202  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1611 aa  201  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.36 
 
 		 1271 aa  198  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  29.97 
 
 		 738 aa  198  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.76 
 
 		 1348 aa  196  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.39 
 
 		 1586 aa  193  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.39 
 
 		 1595 aa  193  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.88 
 
 		 1614 aa  191  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  41.42 
 
 		 423 aa  190  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  31.91 
 
 		 613 aa  189  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.75 
 
 		 1576 aa  184  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  27.1 
 
 		 1560 aa  184  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1551 aa  183  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.86 
 
 		 1572 aa  181  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.26 
 
 		 1550 aa  181  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1531 aa  180  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1177 aa  179  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1390 aa  176  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1527 aa  175  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1554 aa  175  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1547 aa  174  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1520 aa  172  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.43 
 
 		 1362 aa  172  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.86 
 
 		 1568 aa  171  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.83 
 
 		 1509 aa  169  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  27.97 
 
 		 924 aa  169  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  27.01 
 
 		 3193 aa  169  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1602 aa  167  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1917 aa  166  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1942 aa  165  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1390 aa  165  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.02 
 
 		 1429 aa  165  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.02 
 
 		 1488 aa  164  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.55 
 
 		 2035 aa  164  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.87 
 
 		 1599 aa  163  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1402 aa  162  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1834 aa  161  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1400 aa  161  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.14 
 
 		 1518 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1669 aa  159  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26 
 
 		 1485 aa  159  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1959 aa  159  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.3 
 
 		 1427 aa  158  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.22 
 
 		 1609 aa  158  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1418 aa  158  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1409 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.88 
 
 		 1446 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.05 
 
 		 1495 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1411 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.76 
 
 		 2149 aa  155  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1541 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1541 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1541 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.63 
 
 		 1434 aa  154  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1840 aa  154  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.88 
 
 		 1384 aa  152  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.4 
 
 		 1385 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  27.45 
 
 		 2294 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1386 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  31.7 
 
 		 468 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1379 aa  149  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1541 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1541 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1381 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1541 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1527 aa  149  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.56 
 
 		 1259 aa  149  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.17 
 
 		 2003 aa  145  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 1197 aa  145  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 867 aa  145  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1189 aa  145  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1419 aa  145  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.4 
 
 		 1981 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26 
 
 		 1620 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.93 
 
 		 1008 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.93 
 
 		 1008 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 866 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.13 
 
 		 1528 aa  142  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  32.98 
 
 		 583 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>