More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2251 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  100 
 
 		 1577 aa  3228    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  53.71 
 
 		 920 aa  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  54.08 
 
 		 917 aa  834    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  31.87 
 
 		 1467 aa  489  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00576  RhsD protein  52.21 
 
 		 613 aa  475  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  31.26 
 
 		 1381 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  36 
 
 		 913 aa  429  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  37.2 
 
 		 903 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00577  RhsD protein  40.17 
 
 		 683 aa  396  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  36.68 
 
 		 889 aa  390  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  33.42 
 
 		 927 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  31 
 
 		 1177 aa  318  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1198 aa  311  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1301 aa  297  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  35.89 
 
 		 741 aa  290  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  35.94 
 
 		 788 aa  290  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  35.94 
 
 		 788 aa  290  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1433 aa  283  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  34.8 
 
 		 764 aa  280  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  35.47 
 
 		 705 aa  271  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  34.06 
 
 		 690 aa  249  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  32.64 
 
 		 818 aa  227  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  34.22 
 
 		 587 aa  225  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  33.66 
 
 		 499 aa  221  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  30.09 
 
 		 738 aa  219  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.4 
 
 		 2096 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1390 aa  191  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1352 aa  189  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 605 aa  186  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  34.79 
 
 		 468 aa  184  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_003296  RS00943  rhs-related protein  30.19 
 
 		 681 aa  171  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1554 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 2035 aa  168  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.01 
 
 		 1981 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.82 
 
 		 1427 aa  162  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.91 
 
 		 1614 aa  162  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.29 
 
 		 1271 aa  161  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1600 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1550 aa  161  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.51 
 
 		 1586 aa  161  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.19 
 
 		 1595 aa  161  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.82 
 
 		 1560 aa  160  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  28.04 
 
 		 1518 aa  160  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.97 
 
 		 1599 aa  159  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1551 aa  159  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1520 aa  157  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.35 
 
 		 1379 aa  156  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1527 aa  153  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.28 
 
 		 1429 aa  152  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.08 
 
 		 1572 aa  151  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  24.17 
 
 		 1338 aa  151  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.03 
 
 		 1609 aa  150  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1418 aa  149  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.51 
 
 		 2149 aa  149  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.8 
 
 		 1576 aa  148  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.45 
 
 		 1568 aa  148  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1419 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  27.01 
 
 		 1489 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2292  hypothetical protein  32.52 
 
 		 347 aa  146  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1547 aa  146  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.63 
 
 		 1362 aa  146  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1611 aa  145  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 867 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1390 aa  144  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.23 
 
 		 3027 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.62 
 
 		 924 aa  144  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.21 
 
 		 2277 aa  143  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  26.62 
 
 		 1494 aa  143  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1494 aa  143  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.76 
 
 		 1485 aa  142  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 2003 aa  140  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  26.05 
 
 		 1681 aa  139  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1402 aa  138  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1602 aa  136  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1586 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1487 aa  133  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1409 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00941  rhs-related protein  29.35 
 
 		 881 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_003296  RS02144  putative RHS-related transmembrane protein  27.97 
 
 		 863 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 866 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 939 aa  131  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1531 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.42 
 
 		 1488 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  25.58 
 
 		 1359 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.42 
 
 		 1528 aa  128  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.8 
 
 		 1573 aa  127  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1959 aa  128  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1517 aa  126  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.39 
 
 		 1384 aa  125  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1411 aa  125  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.1 
 
 		 2117 aa  125  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.48 
 
 		 1259 aa  125  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1400 aa  125  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1147 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 3073 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1386 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.23 
 
 		 1639 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.09 
 
 		 1509 aa  124  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.9 
 
 		 1385 aa  123  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1197 aa  123  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>