More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2298 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  100 
 
 		 1338 aa  2746    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  31.95 
 
 		 1892 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.5 
 
 		 903 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 927 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.68 
 
 		 889 aa  184  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.36 
 
 		 1560 aa  173  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.12 
 
 		 690 aa  172  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1527 aa  173  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.51 
 
 		 1467 aa  171  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1189 aa  168  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.01 
 
 		 1614 aa  160  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1611 aa  159  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.02 
 
 		 1572 aa  158  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.68 
 
 		 1429 aa  157  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.64 
 
 		 1271 aa  157  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1197 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.61 
 
 		 1518 aa  156  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  24.2 
 
 		 1577 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1531 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1553 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.95 
 
 		 1576 aa  149  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1466 aa  148  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1547 aa  148  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 2035 aa  147  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1301 aa  147  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.66 
 
 		 1981 aa  147  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1390 aa  147  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  26.11 
 
 		 1359 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.05 
 
 		 1362 aa  145  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.42 
 
 		 1595 aa  145  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.16 
 
 		 1530 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1554 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.42 
 
 		 1586 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1433 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.5 
 
 		 1352 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.55 
 
 		 1488 aa  142  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1492 aa  142  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.95 
 
 		 1259 aa  142  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 866 aa  141  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1527 aa  141  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1400 aa  141  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1586 aa  140  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.09 
 
 		 1385 aa  140  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 913 aa  140  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.02 
 
 		 2096 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.85 
 
 		 1381 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 		 1602 aa  140  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1411 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1550 aa  138  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1541 aa  138  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1541 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.06 
 
 		 2149 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1541 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1541 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1381 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1541 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.83 
 
 		 1568 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1551 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1541 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.78 
 
 		 924 aa  136  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1386 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1520 aa  135  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.34 
 
 		 1379 aa  135  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1419 aa  134  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1409 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  24.17 
 
 		 1604 aa  133  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.27 
 
 		 2277 aa  132  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.49 
 
 		 1489 aa  132  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1177 aa  131  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  24.11 
 
 		 1600 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.11 
 
 		 1528 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  23.59 
 
 		 1593 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.67 
 
 		 741 aa  127  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  24.27 
 
 		 917 aa  127  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  23.83 
 
 		 1639 aa  126  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1917 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  23.27 
 
 		 1446 aa  125  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  22.91 
 
 		 1434 aa  125  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  24.47 
 
 		 1475 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1410 aa  122  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1942 aa  123  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  24 
 
 		 920 aa  122  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  23.63 
 
 		 1457 aa  122  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 3193 aa  121  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 867 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  22.97 
 
 		 1573 aa  119  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  23.76 
 
 		 1543 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  21.76 
 
 		 1494 aa  119  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  24.04 
 
 		 1422 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  23.04 
 
 		 1428 aa  118  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1552 aa  118  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1505 aa  118  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.55 
 
 		 1679 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  26.43 
 
 		 693 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  21.66 
 
 		 3027 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  29.84 
 
 		 605 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1317 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.54 
 
 		 1673 aa  116  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  24.62 
 
 		 1710 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.31 
 
 		 1669 aa  115  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>