More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0044 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  100 
 
 		 2117 aa  4328    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  33 
 
 		 1834 aa  288  8e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1517 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  26.17 
 
 		 2017 aa  256  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  30 
 
 		 2138 aa  234  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  35.07 
 
 		 1951 aa  208  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  26.57 
 
 		 2059 aa  195  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.86 
 
 		 1976 aa  193  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  26.38 
 
 		 3456 aa  193  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.17 
 
 		 2094 aa  192  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  26.56 
 
 		 2035 aa  188  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1488 aa  177  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  29.46 
 
 		 2096 aa  174  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1328 aa  166  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.86 
 
 		 3320 aa  164  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  25.18 
 
 		 2076 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  28.86 
 
 		 2290 aa  146  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 927 aa  147  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 2032 aa  145  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  23.2 
 
 		 2494 aa  144  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  26.73 
 
 		 2031 aa  143  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 2031 aa  143  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 2031 aa  143  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1657 aa  142  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  27.79 
 
 		 1140 aa  142  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1806 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1825 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 2448 aa  139  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  28.55 
 
 		 3027 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.46 
 
 		 2277 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  26.61 
 
 		 2283 aa  137  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 2437 aa  136  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1825 aa  136  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  26.21 
 
 		 2401 aa  135  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  25.38 
 
 		 2007 aa  135  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.33 
 
 		 1467 aa  135  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 		 3333 aa  132  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  27.2 
 
 		 2286 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  29.47 
 
 		 690 aa  129  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1577 aa  124  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.41 
 
 		 1271 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1352 aa  125  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.2 
 
 		 726 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 2035 aa  122  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1126 aa  122  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 2402 aa  122  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  26.83 
 
 		 889 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  26.26 
 
 		 2145 aa  120  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  29.22 
 
 		 903 aa  119  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  26.17 
 
 		 1427 aa  113  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1177 aa  112  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.51 
 
 		 2149 aa  111  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  30.9 
 
 		 331 aa  109  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2428 aa  107  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1433 aa  107  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1669 aa  107  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 913 aa  104  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2953  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1127 aa  104  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000628016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 3073 aa  102  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1628 aa  102  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.45 
 
 		 1609 aa  102  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  35.27 
 
 		 1394 aa  101  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  27.03 
 
 		 1140 aa  101  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.13 
 
 		 1593 aa  101  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  31.6 
 
 		 2528 aa  100  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1600 aa  100  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 3689 aa  100  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1854 aa  99.8  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1917 aa  99.4  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  31.82 
 
 		 628 aa  97.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6407  YD repeat protein  26.98 
 
 		 2194 aa  97.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.52 
 
 		 1919 aa  96.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.63 
 
 		 1520 aa  95.5  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  40 
 
 		 608 aa  95.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  30.09 
 
 		 4357 aa  95.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.42 
 
 		 2731 aa  95.1  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  39.47 
 
 		 864 aa  94  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.48 
 
 		 1599 aa  94  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1959 aa  94  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1551 aa  93.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  38.89 
 
 		 793 aa  92.8  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  28.02 
 
 		 2075 aa  92.4  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1527 aa  92  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.95 
 
 		 1381 aa  91.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27 
 
 		 1626 aa  91.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1485 aa  92  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  24.9 
 
 		 2513 aa  91.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1550 aa  91.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 3193 aa  91.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  25.7 
 
 		 920 aa  90.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1547 aa  90.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  25.13 
 
 		 2191 aa  90.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.75 
 
 		 1614 aa  89.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  38.93 
 
 		 940 aa  89.4  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.26 
 
 		 1528 aa  89  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.61 
 
 		 917 aa  89  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.9 
 
 		 3273 aa  88.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.75 
 
 		 1572 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  33.33 
 
 		 835 aa  86.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  27.53 
 
 		 1488 aa  85.9  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>