89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2715 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 864 aa  1716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  40.11 
 
 		 889 aa  174  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1933 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  38.38 
 
 		 858 aa  147  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  34.15 
 
 		 665 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  36.88 
 
 		 901 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 2198 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.14 
 
 		 2807 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1027 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  30.73 
 
 		 3563 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.42 
 
 		 8871 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  34.26 
 
 		 2467 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  29.2 
 
 		 429 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 726 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  39.44 
 
 		 2117 aa  110  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1280 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  37.06 
 
 		 331 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  43.53 
 
 		 456 aa  99.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.51 
 
 		 1183 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1100 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  27.68 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  40.57 
 
 		 841 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  30.49 
 
 		 1991 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  43.51 
 
 		 1081 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  38.6 
 
 		 321 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  35.68 
 
 		 845 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.86 
 
 		 1323 aa  82  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  29.23 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  50 
 
 		 940 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  34.17 
 
 		 2002 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  34.23 
 
 		 720 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  31.36 
 
 		 835 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  41.74 
 
 		 4357 aa  71.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  39.29 
 
 		 998 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1076 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1390 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  30.87 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1588 aa  65.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  36.91 
 
 		 1263 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25.84 
 
 		 2068 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  35.84 
 
 		 608 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  44.35 
 
 		 2082 aa  63.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  32.58 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  36.57 
 
 		 1095 aa  61.6  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  28.34 
 
 		 857 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  36.36 
 
 		 1067 aa  59.7  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  36.56 
 
 		 1222 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 489 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.56 
 
 		 1176 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  36.46 
 
 		 1199 aa  54.3  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  24.2 
 
 		 4433 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1068 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1585 aa  52.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  35.42 
 
 		 869 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  36.69 
 
 		 1462 aa  52.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1176 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  58.54 
 
 		 839 aa  52  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  28.17 
 
 		 432 aa  51.2  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  35.53 
 
 		 446 aa  50.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  44 
 
 		 870 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  49.02 
 
 		 750 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0465  fibronectin type III domain protein  31.31 
 
 		 505 aa  48.9  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.271511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  36.26 
 
 		 708 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1825 aa  48.5  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  24.67 
 
 		 400 aa  48.5  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.59 
 
 		 1523 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.09 
 
 		 1272 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.41 
 
 		 2927 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  23.62 
 
 		 403 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  25.1 
 
 		 549 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  31.28 
 
 		 440 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  20.6 
 
 		 505 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  33.61 
 
 		 692 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  41.67 
 
 		 826 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0446  fibronectin type III domain-containing protein  28.93 
 
 		 499 aa  46.6  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00035766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  43.1 
 
 		 1004 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  34.15 
 
 		 278 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3344  hypothetical protein  27.46 
 
 		 408 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.844152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  53.85 
 
 		 1303 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  32.61 
 
 		 277 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  54.55 
 
 		 792 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  30.52 
 
 		 2286 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  35.14 
 
 		 523 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1394 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  32.39 
 
 		 486 aa  45.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  23.91 
 
 		 491 aa  44.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  30.99 
 
 		 486 aa  44.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  35.59 
 
 		 430 aa  44.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.66 
 
 		 948 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>