41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2340 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  100 
 
 
845 aa  1716    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  68.85 
 
 
841 aa  1053    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  33.33 
 
 
1004 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.98 
 
 
1323 aa  148  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  44.68 
 
 
456 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  49.66 
 
 
2002 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  27.46 
 
 
843 aa  128  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  38.37 
 
 
331 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  33.55 
 
 
998 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2129  peptidase C10 streptopain  26.49 
 
 
405 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0701218  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  25.28 
 
 
884 aa  95.9  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  37.43 
 
 
720 aa  92  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  38.19 
 
 
940 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  37.93 
 
 
1027 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  29.5 
 
 
792 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  36.94 
 
 
514 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  36.99 
 
 
835 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  32.56 
 
 
2117 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.69 
 
 
1453 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.75 
 
 
726 aa  72  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  33.33 
 
 
582 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  41.18 
 
 
1081 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  35.76 
 
 
864 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.03 
 
 
1451 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  35.19 
 
 
1407 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  32.64 
 
 
321 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  44.57 
 
 
1390 aa  64.3  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  38.55 
 
 
1222 aa  62  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0864  peptidase C10 streptopain  22.7 
 
 
431 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.607633  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  30.22 
 
 
1263 aa  61.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  44.58 
 
 
1076 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  43.53 
 
 
4357 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  43 
 
 
2082 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.25 
 
 
1095 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  31.75 
 
 
1514 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.27 
 
 
608 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  31.58 
 
 
708 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 
797 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  35.11 
 
 
665 aa  48.5  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  41.27 
 
 
917 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0881  hypothetical protein  36.11 
 
 
309 aa  45.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000614715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>