41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2338 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  68.85 
 
 
845 aa  1125    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  100 
 
 
841 aa  1707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  37.34 
 
 
1004 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  55.56 
 
 
2002 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.71 
 
 
1323 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  41.27 
 
 
456 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  44.38 
 
 
331 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  28.06 
 
 
843 aa  112  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  32.89 
 
 
998 aa  101  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  27.7 
 
 
884 aa  92.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  40.14 
 
 
940 aa  88.2  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  38.93 
 
 
1027 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  35.47 
 
 
720 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  38.31 
 
 
864 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  36.91 
 
 
514 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2129  peptidase C10 streptopain  22.02 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0701218  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.71 
 
 
2117 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  36.09 
 
 
582 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.16 
 
 
726 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.01 
 
 
1453 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  32 
 
 
835 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  34 
 
 
792 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  42.21 
 
 
1081 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0864  peptidase C10 streptopain  24.12 
 
 
431 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.607633  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.9 
 
 
1451 aa  63.9  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  35.06 
 
 
321 aa  62.4  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  40.96 
 
 
1222 aa  60.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.83 
 
 
1095 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  42.17 
 
 
4357 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  45.35 
 
 
1263 aa  58.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  31.87 
 
 
1514 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  32.58 
 
 
608 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  31.68 
 
 
1407 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  40.22 
 
 
1390 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  43.18 
 
 
2082 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  41.25 
 
 
1076 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  32.63 
 
 
708 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  40.7 
 
 
750 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  47.27 
 
 
826 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.83 
 
 
797 aa  45.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  38.3 
 
 
665 aa  44.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>