49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1680 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  100 
 
 
1263 aa  2444    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  32.03 
 
 
1390 aa  267  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  42.6 
 
 
4357 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  46.15 
 
 
456 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  34.41 
 
 
848 aa  111  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  39.83 
 
 
940 aa  95.1  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  41.76 
 
 
1027 aa  84  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  29.77 
 
 
432 aa  80.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.67 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  26.39 
 
 
446 aa  67.4  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  33.12 
 
 
1626 aa  67.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  43.52 
 
 
2082 aa  66.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  51.28 
 
 
1095 aa  64.7  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  27.6 
 
 
446 aa  63.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  30.23 
 
 
1544 aa  62.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  28.21 
 
 
845 aa  62  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  42.86 
 
 
2117 aa  61.6  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  47.13 
 
 
331 aa  60.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  45.33 
 
 
1076 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  26.67 
 
 
769 aa  60.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  27.4 
 
 
1042 aa  59.3  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  51.43 
 
 
720 aa  58.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  22.73 
 
 
545 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  46.77 
 
 
1081 aa  57  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  24.89 
 
 
728 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  46.43 
 
 
835 aa  55.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  37.32 
 
 
3822 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  46.05 
 
 
2002 aa  54.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
1361 aa  54.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  32.75 
 
 
864 aa  53.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  38.37 
 
 
708 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.76 
 
 
726 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  43.21 
 
 
839 aa  53.5  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  42.25 
 
 
321 aa  52.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  35.35 
 
 
514 aa  52.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0145  hypothetical protein  20.9 
 
 
961 aa  52  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.77 
 
 
1323 aa  52  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  26.18 
 
 
6276 aa  50.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  27.92 
 
 
1202 aa  50.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  49.06 
 
 
792 aa  50.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  45.95 
 
 
870 aa  49.7  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.71 
 
 
607 aa  49.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  31.3 
 
 
1222 aa  48.5  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  43.02 
 
 
841 aa  48.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  38.83 
 
 
3861 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1806  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.74 
 
 
2177 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  38.24 
 
 
608 aa  47.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  29.73 
 
 
510 aa  45.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  29.68 
 
 
171 aa  45.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>