56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1212 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1031    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  84.31 
 
 		 509 aa  871    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  81.37 
 
 		 509 aa  841    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 900 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  31.13 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 871 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 890 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 898 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.01 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  35.78 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0119  hypothetical protein  26.16 
 
 		 901 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  30.41 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  24.31 
 
 		 1619 aa  57.4  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  30.14 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.05 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 561 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0090  hypothetical protein  28.05 
 
 		 860 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000863747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.11 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.45 
 
 		 477 aa  53.9  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.64 
 
 		 1343 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 316 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.05 
 
 		 925 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  27.52 
 
 		 293 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.64 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1873  hypothetical protein  28.68 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.505982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.08 
 
 		 309 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  23.25 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24 
 
 		 708 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.02 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.74 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.88 
 
 		 1196 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0112  hypothetical protein  27.78 
 
 		 846 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0116921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.28 
 
 		 590 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1156  hypothetical protein  25.16 
 
 		 846 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.03 
 
 		 1106 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1274 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  27.78 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.09 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.46 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1462  hypothetical protein  28.66 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.947543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 		 629 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.2 
 
 		 795 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.2 
 
 		 795 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0488  Legumain  27.18 
 
 		 726 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.84 
 
 		 615 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 		 531 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.16 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 		 718 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.94 
 
 		 1004 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  32.06 
 
 		 1263 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.95 
 
 		 1004 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  22.08 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.1 
 
 		 713 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>