70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1374 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 301 aa  624  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.09 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.25 
 
 		 633 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34 
 
 		 615 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.9 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.61 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  36.36 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  34.01 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 789 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.21 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 		 711 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 		 711 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  31.52 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 		 871 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  28.04 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  30.26 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 		 717 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.67 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  28.39 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.06 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1316 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.38 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.45 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.15 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  24.67 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 		 979 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.95 
 
 		 561 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.64 
 
 		 719 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  31.43 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1097 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.81 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  28.77 
 
 		 509 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.11 
 
 		 343 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 900 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  28.77 
 
 		 509 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  29.22 
 
 		 420 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 898 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 		 491 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 590 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.8 
 
 		 841 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.76 
 
 		 428 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 729 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.14 
 
 		 843 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  26.92 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 890 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  28.37 
 
 		 510 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  28.66 
 
 		 633 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  30.67 
 
 		 463 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.2 
 
 		 658 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  31.58 
 
 		 540 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.69 
 
 		 850 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  37.25 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.75 
 
 		 612 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  24.75 
 
 		 609 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.89 
 
 		 612 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.54 
 
 		 1554 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 		 466 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  22.96 
 
 		 1160 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.38 
 
 		 1106 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  21.14 
 
 		 442 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.34 
 
 		 648 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.73 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  30.41 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>