46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6052 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 538 aa  1073    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  91.26 
 
 		 538 aa  964    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.77 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0281  hypothetical protein  35.75 
 
 		 280 aa  127  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.61 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 		 1316 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  28.66 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.61 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.79 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.45 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.92 
 
 		 850 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  29.68 
 
 		 277 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 898 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 261 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.08 
 
 		 979 aa  50.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.82 
 
 		 633 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  34.26 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 890 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  25 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.71 
 
 		 355 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  24.33 
 
 		 871 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 		 612 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  24.34 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  26 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.72 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.35 
 
 		 343 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 		 729 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1274 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 		 795 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 		 795 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  24.39 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.84 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.47 
 
 		 789 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 		 579 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 		 464 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  30.71 
 
 		 297 aa  43.5  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>