30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32992 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  100 
 
 
633 aa  1318    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  33.33 
 
 
322 aa  192  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  31.03 
 
 
404 aa  174  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  36.1 
 
 
369 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  36.24 
 
 
292 aa  154  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  33 
 
 
378 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  34.39 
 
 
403 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  35.14 
 
 
420 aa  97.4  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  35.26 
 
 
438 aa  97.1  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  31.95 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  36.09 
 
 
517 aa  72.8  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  28.86 
 
 
293 aa  63.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
491 aa  62.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
979 aa  55.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.12 
 
 
666 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
305 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  28.75 
 
 
540 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.28 
 
 
641 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24 
 
 
615 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.79 
 
 
907 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.39 
 
 
298 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
301 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 
278 aa  47.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 
302 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.83 
 
 
615 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  31.67 
 
 
277 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
850 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 
1343 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 
1494 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
612 aa  43.9  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>