55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1373 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 305 aa  627  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.09 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 615 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.33 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  33.77 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.91 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 		 850 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.33 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 		 805 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 		 789 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 		 711 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 		 871 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 		 538 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 		 900 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.43 
 
 		 666 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.55 
 
 		 903 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  24.01 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 898 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.19 
 
 		 979 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  35.96 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.06 
 
 		 890 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  31.25 
 
 		 633 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.78 
 
 		 717 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.44 
 
 		 442 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 		 428 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 		 538 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  24.26 
 
 		 403 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  30.69 
 
 		 540 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  24.83 
 
 		 463 aa  49.7  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 261 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.87 
 
 		 469 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 590 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.52 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.84 
 
 		 633 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  27.52 
 
 		 609 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.73 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 		 612 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.35 
 
 		 1343 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 907 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  25.75 
 
 		 438 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  28.46 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  23.49 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  35.23 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  25.97 
 
 		 1619 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.36 
 
 		 1316 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  30.68 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  25.34 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>