55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1607 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  63.06 
 
 
275 aa  362  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  61.25 
 
 
270 aa  346  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  61.05 
 
 
285 aa  328  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.91 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  37.16 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.83 
 
 
278 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.33 
 
 
298 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  33.55 
 
 
403 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.36 
 
 
979 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
907 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  32.79 
 
 
378 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  34.87 
 
 
463 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 
615 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 
615 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  31.77 
 
 
438 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  32.12 
 
 
420 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.67 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  40 
 
 
517 aa  85.9  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  28.87 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.95 
 
 
491 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.48 
 
 
633 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  33.97 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.26 
 
 
612 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.11 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.72 
 
 
612 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  32.72 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.28 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  28.21 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.91 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  30.36 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  32.91 
 
 
404 aa  62.4  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.67 
 
 
265 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.47 
 
 
717 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 
654 aa  58.9  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 
431 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 
789 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.81 
 
 
719 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 
464 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 
1316 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.13 
 
 
648 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  32.9 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  34.55 
 
 
671 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 
805 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1129  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
608 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0156816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 
666 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 
890 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 
898 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.98 
 
 
711 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.98 
 
 
711 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  21.82 
 
 
900 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 
531 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>