32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1383 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 431 aa  810    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.72 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.75 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.25 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  33.33 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.25 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 		 538 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 		 666 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 633 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.64 
 
 		 562 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  34.07 
 
 		 277 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.89 
 
 		 275 aa  53.5  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  31.45 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.59 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.63 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 850 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.25 
 
 		 1316 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  25.56 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 641 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.79 
 
 		 979 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.16 
 
 		 841 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2823  hypothetical protein  26.28 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.605143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 1155 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 		 843 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 		 343 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  28.22 
 
 		 369 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.61 
 
 		 907 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>