44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6953 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
850 aa  1651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  29.5 
 
 
540 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.5 
 
 
666 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
641 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 
1316 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.92 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.6 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
633 aa  69.3  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 
305 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  25.82 
 
 
293 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 
654 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 
298 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.42 
 
 
538 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  34.46 
 
 
322 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 
309 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  31.33 
 
 
369 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.46 
 
 
469 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.92 
 
 
538 aa  54.7  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
324 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
789 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.32 
 
 
491 aa  50.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  27.52 
 
 
404 aa  50.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.36 
 
 
841 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  22.83 
 
 
277 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.72 
 
 
1731 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 
275 aa  48.9  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  31.28 
 
 
205 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.09 
 
 
717 aa  47.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.69 
 
 
301 aa  47.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  30.63 
 
 
463 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.65 
 
 
1196 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  26.19 
 
 
292 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.89 
 
 
477 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
576 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  26.28 
 
 
403 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
979 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  24.89 
 
 
636 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  25.62 
 
 
902 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  28 
 
 
438 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 
890 aa  45.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  25 
 
 
633 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.83 
 
 
711 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.28 
 
 
843 aa  44.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.54 
 
 
302 aa  44.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>