59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1604 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1604  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  50 
 
 		 1343 aa  201  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.23 
 
 		 469 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.34 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.5 
 
 		 309 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.1 
 
 		 457 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.72 
 
 		 355 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.99 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.99 
 
 		 578 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.99 
 
 		 578 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 		 898 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  28 
 
 		 903 aa  58.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 641 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.08 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 		 615 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 		 615 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 		 428 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 		 445 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  24.5 
 
 		 871 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.44 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 		 850 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 445 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 890 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  31.13 
 
 		 442 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  35.14 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 		 531 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.56 
 
 		 1097 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 1106 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 		 666 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  23.81 
 
 		 509 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 		 1004 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 		 305 aa  48.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  24.31 
 
 		 509 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 576 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  27.84 
 
 		 378 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.57 
 
 		 633 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 478 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.5 
 
 		 1711 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 		 515 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.05 
 
 		 397 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.4 
 
 		 841 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 		 477 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 479 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.47 
 
 		 495 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.28 
 
 		 1196 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  22.54 
 
 		 510 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 485 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 		 843 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 1760 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1553 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  28.99 
 
 		 587 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.6 
 
 		 830 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.06 
 
 		 324 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 		 657 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 485 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.47 
 
 		 1004 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>