More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4708 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.27 
 
 
1004 aa  867    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
1004 aa  2031    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  30.53 
 
 
712 aa  222  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.55 
 
 
693 aa  219  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  29.55 
 
 
729 aa  212  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  27.52 
 
 
723 aa  207  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  26.7 
 
 
726 aa  206  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.57 
 
 
756 aa  200  9e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 
708 aa  194  7e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
706 aa  194  9e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  28.92 
 
 
760 aa  193  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.74 
 
 
715 aa  189  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  27.81 
 
 
799 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  28.35 
 
 
727 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.96 
 
 
694 aa  179  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.71 
 
 
739 aa  177  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  31.37 
 
 
824 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.55 
 
 
710 aa  174  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.93 
 
 
729 aa  171  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.08 
 
 
791 aa  171  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.18 
 
 
700 aa  171  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
662 aa  165  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.9 
 
 
751 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.41 
 
 
799 aa  161  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.82 
 
 
709 aa  159  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.9 
 
 
707 aa  157  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.67 
 
 
746 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.98 
 
 
707 aa  155  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.54 
 
 
747 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.31 
 
 
747 aa  147  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  26.86 
 
 
808 aa  145  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.33 
 
 
707 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
1265 aa  134  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  27.64 
 
 
908 aa  124  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  26.17 
 
 
903 aa  125  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.22 
 
 
996 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  27.54 
 
 
936 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.53 
 
 
952 aa  122  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  28.19 
 
 
908 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  27.44 
 
 
908 aa  122  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  26.82 
 
 
1055 aa  121  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.16 
 
 
889 aa  121  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  27.67 
 
 
893 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.63 
 
 
929 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  28.98 
 
 
402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.48 
 
 
921 aa  119  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  26.88 
 
 
924 aa  119  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.8 
 
 
695 aa  118  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  27.68 
 
 
927 aa  118  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  28.49 
 
 
919 aa  117  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  27.94 
 
 
906 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.83 
 
 
927 aa  117  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  26.89 
 
 
904 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  24.53 
 
 
874 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.84 
 
 
667 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.84 
 
 
951 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  26.78 
 
 
890 aa  112  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.23 
 
 
820 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  27.43 
 
 
906 aa  111  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  26.29 
 
 
905 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.45 
 
 
933 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  26.33 
 
 
909 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
1230 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.49 
 
 
1166 aa  108  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.6 
 
 
926 aa  107  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.19 
 
 
669 aa  107  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  25.17 
 
 
901 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  25.93 
 
 
1060 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  26.26 
 
 
924 aa  106  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  25.27 
 
 
1173 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.76 
 
 
762 aa  105  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.99 
 
 
816 aa  105  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  28.02 
 
 
1165 aa  104  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.49 
 
 
919 aa  104  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.71 
 
 
803 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  26.17 
 
 
924 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  25.05 
 
 
916 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.77 
 
 
780 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.21 
 
 
825 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  24.83 
 
 
1073 aa  99.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.68 
 
 
1318 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.53 
 
 
810 aa  99.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.97 
 
 
800 aa  99.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.23 
 
 
917 aa  99  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 
278 aa  98.6  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 
856 aa  98.6  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  27.78 
 
 
882 aa  97.8  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.55 
 
 
807 aa  97.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.5 
 
 
876 aa  97.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.43 
 
 
1197 aa  97.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  26.84 
 
 
1767 aa  97.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  26.73 
 
 
869 aa  96.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.72 
 
 
817 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  27.23 
 
 
1173 aa  96.3  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  25.26 
 
 
908 aa  96.3  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  26.96 
 
 
877 aa  95.5  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  26.63 
 
 
825 aa  95.5  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.3 
 
 
873 aa  95.5  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.71 
 
 
785 aa  95.5  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.57 
 
 
868 aa  94.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>