122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0029 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
397 aa  777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  75.36 
 
 
442 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  61.18 
 
 
798 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  39.74 
 
 
500 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.89 
 
 
499 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.87 
 
 
501 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.89 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.04 
 
 
497 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  40.74 
 
 
482 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  36.06 
 
 
486 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  35.58 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.15 
 
 
778 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.7 
 
 
839 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.74 
 
 
784 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  34.19 
 
 
449 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
1056 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.2 
 
 
421 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 
1056 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 
988 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.6 
 
 
502 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.83 
 
 
479 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.05 
 
 
554 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.2 
 
 
445 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.95 
 
 
718 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.8 
 
 
629 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 
1022 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  32.61 
 
 
576 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.98 
 
 
818 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
1155 aa  96.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.29 
 
 
489 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.72 
 
 
713 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
486 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.97 
 
 
490 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  31.87 
 
 
619 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  31.86 
 
 
499 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 
708 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.23 
 
 
971 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.05 
 
 
478 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 
971 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.2 
 
 
515 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.18 
 
 
495 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.45 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 
1026 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.71 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 
728 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.55 
 
 
680 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  31.23 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.56 
 
 
860 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  29.05 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 
859 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  29.96 
 
 
527 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.22 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.73 
 
 
649 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  26.54 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.02 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  31.47 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.35 
 
 
541 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.96 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.95 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 
766 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  28.7 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.86 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.51 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.81 
 
 
616 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  31.65 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.13 
 
 
862 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  28.79 
 
 
798 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.48 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.6 
 
 
824 aa  63.5  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
291 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 
288 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 
828 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 
652 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 
291 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 
657 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 
570 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1470  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 
753 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  21.91 
 
 
1097 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.35 
 
 
915 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  27.74 
 
 
670 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  30.56 
 
 
654 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 
324 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 
902 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  25.98 
 
 
535 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 
813 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.56 
 
 
324 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  27.78 
 
 
331 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
776 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  31 
 
 
781 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 
393 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.03 
 
 
979 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 
941 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 
615 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  24.2 
 
 
902 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>