More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3994 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  58.35 
 
 		 616 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 657 aa  1346    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  84.63 
 
 		 654 aa  1093    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  57.75 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  49.79 
 
 		 523 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  47.27 
 
 		 535 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  46.95 
 
 		 570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  49.36 
 
 		 698 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  50.22 
 
 		 497 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  49.58 
 
 		 611 aa  230  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  44.33 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  45.27 
 
 		 291 aa  203  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  41.42 
 
 		 292 aa  197  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  36.18 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.89 
 
 		 636 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  40.96 
 
 		 289 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  39.62 
 
 		 301 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 616 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  31.61 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.36 
 
 		 554 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  36.59 
 
 		 284 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  37.11 
 
 		 286 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  36.47 
 
 		 283 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  34.52 
 
 		 416 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  36.19 
 
 		 282 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  37.55 
 
 		 802 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  36.19 
 
 		 288 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  35.09 
 
 		 620 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 		 617 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  37.16 
 
 		 293 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  39.66 
 
 		 277 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 618 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.75 
 
 		 628 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 637 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  35.88 
 
 		 303 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  39.11 
 
 		 292 aa  154  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  37.07 
 
 		 292 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  40.25 
 
 		 358 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 882 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 637 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  37.87 
 
 		 820 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  39.06 
 
 		 587 aa  151  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 		 625 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  32.23 
 
 		 781 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  38.43 
 
 		 551 aa  150  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 		 621 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  38.98 
 
 		 892 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 		 593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  33.46 
 
 		 240 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  38.14 
 
 		 269 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  37.14 
 
 		 346 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  36.69 
 
 		 246 aa  147  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.8 
 
 		 654 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  36.09 
 
 		 338 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  34.06 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  35.36 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  37.19 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 		 620 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  37.34 
 
 		 287 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  36.63 
 
 		 925 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  37.89 
 
 		 267 aa  144  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  37.5 
 
 		 522 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  36.36 
 
 		 929 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  38.4 
 
 		 740 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 		 623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  38.76 
 
 		 351 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  36.09 
 
 		 611 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  33.92 
 
 		 446 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  33.92 
 
 		 549 aa  140  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  33.64 
 
 		 477 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.92 
 
 		 600 aa  140  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  31.76 
 
 		 952 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  36.78 
 
 		 336 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  37.04 
 
 		 877 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 		 639 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 		 639 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.07 
 
 		 971 aa  137  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1911 aa  137  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  30.75 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35.27 
 
 		 1104 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 971 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.93 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  36.02 
 
 		 281 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  32.93 
 
 		 287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1196 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  35.71 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  37.1 
 
 		 862 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  35.8 
 
 		 664 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 		 1132 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  34.67 
 
 		 922 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  39.11 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.37 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.77 
 
 		 263 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  32.58 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  32.13 
 
 		 293 aa  124  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  35.86 
 
 		 285 aa  123  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  34.11 
 
 		 305 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.61 
 
 		 826 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>