More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3940 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  42.66 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  43.45 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  41.46 
 
 		 586 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  44.03 
 
 		 523 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  41.35 
 
 		 413 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  43.88 
 
 		 535 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  43.7 
 
 		 570 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  40.25 
 
 		 616 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  40.6 
 
 		 654 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 		 698 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  36.12 
 
 		 929 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  42.26 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  39.66 
 
 		 657 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  38.84 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  36.78 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  38.43 
 
 		 603 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  37.86 
 
 		 416 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  40.17 
 
 		 491 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  37.39 
 
 		 522 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 		 882 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  33.46 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  36.8 
 
 		 781 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.18 
 
 		 925 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  38.84 
 
 		 636 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  38.84 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  38.89 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  34.8 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  38.82 
 
 		 497 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  35.94 
 
 		 892 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 		 620 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  36.58 
 
 		 664 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  34.71 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 621 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  36.69 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  34.04 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  35.42 
 
 		 628 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  36.51 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.95 
 
 		 820 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1911 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  33.46 
 
 		 654 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 		 616 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 		 637 aa  135  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 538 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  36.05 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  34.69 
 
 		 740 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  32.71 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 593 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  34.44 
 
 		 802 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  33.59 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 		 611 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.11 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  34.1 
 
 		 527 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  37.89 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.22 
 
 		 600 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  33.22 
 
 		 549 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 		 617 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 		 618 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 		 625 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  33.47 
 
 		 284 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 		 639 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  33.56 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 		 639 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 		 1132 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  32.87 
 
 		 556 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  35.02 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.61 
 
 		 398 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1196 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 637 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.89 
 
 		 1104 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  35.56 
 
 		 620 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  32.66 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  33.07 
 
 		 862 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  34.05 
 
 		 412 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  34.3 
 
 		 398 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  32.7 
 
 		 605 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  36.97 
 
 		 475 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  34.69 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  31.64 
 
 		 453 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  35.66 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 		 623 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.65 
 
 		 554 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  33.9 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  33.76 
 
 		 668 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  33.19 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  31.06 
 
 		 826 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.47 
 
 		 586 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  32.13 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  33.73 
 
 		 877 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.34 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  34.47 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  29.48 
 
 		 624 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  37.95 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.57 
 
 		 517 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  33.06 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>