More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1976 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 319 aa  666    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  60.19 
 
 		 742 aa  417  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  61.54 
 
 		 586 aa  371  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  55.35 
 
 		 751 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  62.17 
 
 		 826 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  60.37 
 
 		 433 aa  354  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  56.76 
 
 		 829 aa  349  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  52.35 
 
 		 517 aa  335  5e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  54.07 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  50.7 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  53.31 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  49.26 
 
 		 398 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  46.49 
 
 		 517 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  38.15 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  49.73 
 
 		 1581 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1911 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  44.26 
 
 		 1132 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  37.6 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 620 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 		 1104 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  35.83 
 
 		 781 aa  158  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  35.94 
 
 		 527 aa  158  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  38.52 
 
 		 877 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  35.61 
 
 		 892 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  36.65 
 
 		 636 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  37.5 
 
 		 603 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  35.17 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 		 617 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 882 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 		 740 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 637 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 		 625 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  35.94 
 
 		 522 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  35.66 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 621 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.94 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 		 593 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  34.72 
 
 		 929 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  33.58 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 925 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35.55 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  34.19 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.6 
 
 		 820 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  31.48 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  32.51 
 
 		 538 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  33.22 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.67 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 		 637 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 616 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  32.7 
 
 		 620 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  31.82 
 
 		 802 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  37.1 
 
 		 862 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  32.82 
 
 		 416 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  35.07 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  35.4 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  32 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  34.07 
 
 		 600 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  34.07 
 
 		 549 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  32.76 
 
 		 654 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 		 618 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  34.43 
 
 		 664 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  43.68 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  30.39 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  32.57 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.48 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  31.19 
 
 		 426 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  38.35 
 
 		 584 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 639 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  35.79 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 639 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  35.02 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  36.88 
 
 		 768 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 556 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 623 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  37.34 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  35 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  33.79 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  32.96 
 
 		 628 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  33.02 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  32.95 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.43 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  42.19 
 
 		 1064 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  28.43 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29.29 
 
 		 614 aa  119  7e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.72 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  38.07 
 
 		 692 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  35.61 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  32.55 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.38 
 
 		 554 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 		 715 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.7 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>