More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1144 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.28 
 
 
554 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  38.05 
 
 
348 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  37.71 
 
 
348 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  37.37 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  40 
 
 
826 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  36.12 
 
 
338 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  36.86 
 
 
586 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 
433 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.74 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  34.75 
 
 
829 aa  136  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  38.57 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.98 
 
 
751 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  37.34 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.91 
 
 
517 aa  126  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  33.22 
 
 
742 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.67 
 
 
267 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 
517 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  35.77 
 
 
398 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  34.44 
 
 
446 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  32.48 
 
 
398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  29.73 
 
 
952 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  29.7 
 
 
331 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  32.84 
 
 
282 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  40.11 
 
 
337 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  31.8 
 
 
551 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  31.36 
 
 
312 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  31.3 
 
 
409 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  33.05 
 
 
605 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  30.88 
 
 
390 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  30.34 
 
 
636 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
349 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  32.17 
 
 
600 aa  99.4  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 
367 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  30.88 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  29.47 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 
509 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  31.93 
 
 
549 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  32.55 
 
 
349 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  30.56 
 
 
556 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  28.17 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  32.88 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  34.08 
 
 
349 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  35.24 
 
 
349 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  32.76 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.46 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  30.15 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  28.36 
 
 
276 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  32.16 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  28.38 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  30.69 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  33.05 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  29.8 
 
 
377 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.57 
 
 
1911 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  29.8 
 
 
421 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 
628 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  28.98 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 
263 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 
351 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  33.63 
 
 
349 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
555 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  29.47 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  27.55 
 
 
282 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 
375 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  28.1 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  28.68 
 
 
254 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  29.7 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  31.25 
 
 
587 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  34.08 
 
 
349 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  35.81 
 
 
316 aa  92  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  35.38 
 
 
338 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  31.17 
 
 
408 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  31.44 
 
 
1160 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  28.08 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  29.29 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  26.82 
 
 
624 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  28.17 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  35.06 
 
 
351 aa  89.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  28.62 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  31.92 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  32.73 
 
 
570 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  30.1 
 
 
298 aa  89  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.28 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  32.97 
 
 
923 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0078  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
872 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  33.82 
 
 
334 aa  87  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  29.43 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  27.64 
 
 
269 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
319 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
322 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  29.03 
 
 
586 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>