More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1079 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
267 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  61.68 
 
 
586 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  59.52 
 
 
433 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  55.56 
 
 
826 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  61.98 
 
 
398 aa  312  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  58.46 
 
 
517 aa  311  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  58.08 
 
 
398 aa  308  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  57.99 
 
 
751 aa  305  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  55.64 
 
 
742 aa  304  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  59.4 
 
 
325 aa  304  9.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  55.56 
 
 
829 aa  299  4e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  50.7 
 
 
319 aa  297  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  52.45 
 
 
517 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  41.09 
 
 
1911 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  41.84 
 
 
802 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  43.7 
 
 
781 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  43.09 
 
 
269 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  40.78 
 
 
1104 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  41.63 
 
 
892 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  40.41 
 
 
925 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  42.13 
 
 
527 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  43.88 
 
 
820 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  42.25 
 
 
1132 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 
617 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 
625 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  44.34 
 
 
882 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  43.57 
 
 
621 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  43.98 
 
 
620 aa  181  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  45.21 
 
 
636 aa  181  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  43.82 
 
 
358 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  41.08 
 
 
351 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  44.8 
 
 
603 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  41.03 
 
 
862 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  39.73 
 
 
929 aa  178  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  41.15 
 
 
522 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  37.88 
 
 
287 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  42.57 
 
 
740 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
637 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
593 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  37.73 
 
 
538 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  38.24 
 
 
453 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  40.47 
 
 
620 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
623 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
618 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  39.75 
 
 
287 aa  171  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  42.04 
 
 
616 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  41.04 
 
 
877 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  42.79 
 
 
289 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  37.55 
 
 
346 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  36.67 
 
 
654 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  35.33 
 
 
489 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  38.11 
 
 
1196 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  40.08 
 
 
664 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  38.98 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  36.25 
 
 
426 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  36.55 
 
 
1581 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 
639 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 
639 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  40.57 
 
 
637 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  35.88 
 
 
293 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  36.5 
 
 
584 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  37.92 
 
 
416 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 
288 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  40.94 
 
 
768 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  36.12 
 
 
305 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  38.4 
 
 
298 aa  148  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  37.8 
 
 
334 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  39.31 
 
 
263 aa  145  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  40 
 
 
291 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  39.29 
 
 
276 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  37.39 
 
 
446 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
359 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  36.69 
 
 
277 aa  141  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.55 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  35.02 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  39.24 
 
 
475 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.22 
 
 
390 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  35.74 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  35.74 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  32.62 
 
 
692 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 
715 aa  138  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.89 
 
 
348 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  37.04 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.96 
 
 
554 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  34.72 
 
 
1186 aa  132  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  34.39 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  33 
 
 
1064 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  32.63 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  37.26 
 
 
668 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  37.3 
 
 
587 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  35.61 
 
 
586 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  34.25 
 
 
952 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.33 
 
 
600 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  33.33 
 
 
549 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  34.67 
 
 
300 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  33.46 
 
 
287 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
303 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  36.58 
 
 
298 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  36.32 
 
 
497 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>