More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4067 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
336 aa  699    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  69.09 
 
 
334 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  53.17 
 
 
321 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  53.25 
 
 
359 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  48.19 
 
 
323 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  46.35 
 
 
401 aa  292  6e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  40.29 
 
 
587 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  40.89 
 
 
892 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  38.22 
 
 
826 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.53 
 
 
586 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  34.05 
 
 
433 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  35.31 
 
 
664 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.17 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.17 
 
 
751 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 
617 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.14 
 
 
820 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  33.68 
 
 
336 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  34.91 
 
 
287 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  37.28 
 
 
522 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  34.64 
 
 
1196 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  35.64 
 
 
740 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
616 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  37.3 
 
 
636 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  36.44 
 
 
1911 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.39 
 
 
267 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  32.13 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.98 
 
 
517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
637 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  41.12 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 
398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  33.09 
 
 
829 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 
398 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  35.07 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  34.89 
 
 
929 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  37.24 
 
 
611 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  35.29 
 
 
527 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  34.62 
 
 
269 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 
358 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  38.25 
 
 
293 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  34.57 
 
 
351 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  46.62 
 
 
475 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 
298 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
620 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  34.4 
 
 
781 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
882 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.62 
 
 
338 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  35.02 
 
 
263 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  31.18 
 
 
802 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  34.33 
 
 
862 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
625 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
637 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  35.45 
 
 
267 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 
925 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  32.76 
 
 
603 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.76 
 
 
517 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  39.49 
 
 
768 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  33.19 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  34.52 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  32.25 
 
 
416 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 
346 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.56 
 
 
742 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  32.12 
 
 
246 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 
319 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  34.84 
 
 
668 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
593 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 
620 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  32.13 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 
1132 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 
618 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
639 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
639 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 
1104 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  31.46 
 
 
279 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  31.58 
 
 
922 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  32.49 
 
 
301 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  30.66 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  34.55 
 
 
488 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
715 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 
623 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  34.01 
 
 
877 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
621 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  30.19 
 
 
305 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
554 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.47 
 
 
446 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.2 
 
 
390 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  32.27 
 
 
283 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  32.61 
 
 
654 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  30.82 
 
 
293 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  32.27 
 
 
284 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 
453 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.87 
 
 
348 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  31.21 
 
 
303 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  35.94 
 
 
245 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  31.44 
 
 
293 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  31.49 
 
 
327 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  30.91 
 
 
282 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  29.04 
 
 
292 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  31.66 
 
 
287 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  32.34 
 
 
586 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  32.64 
 
 
282 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>