More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0288 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  100 
 
 
922 aa  1866    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  46.44 
 
 
279 aa  230  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  45.24 
 
 
276 aa  206  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  46.84 
 
 
263 aa  197  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  46.4 
 
 
282 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  47.11 
 
 
446 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  37.17 
 
 
952 aa  195  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  36.69 
 
 
296 aa  168  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  42.92 
 
 
475 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  38.3 
 
 
267 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  36.51 
 
 
262 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  40.35 
 
 
587 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  37.21 
 
 
254 aa  146  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  38.5 
 
 
611 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.49 
 
 
1652 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  31.41 
 
 
416 aa  145  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 
637 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  33.92 
 
 
929 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.96 
 
 
554 aa  142  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  37.55 
 
 
358 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  36.17 
 
 
715 aa  141  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  36.69 
 
 
336 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  37.34 
 
 
287 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  39 
 
 
620 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
617 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.63 
 
 
1363 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.01 
 
 
1193 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
625 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.5 
 
 
696 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.53 
 
 
1262 aa  137  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  34.76 
 
 
288 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  37.93 
 
 
293 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.64 
 
 
947 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  37.55 
 
 
820 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  34.21 
 
 
1878 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.8 
 
 
740 aa  134  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  134  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.97 
 
 
1831 aa  134  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  35.38 
 
 
768 aa  134  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  33.47 
 
 
346 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  30.49 
 
 
654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  34.49 
 
 
618 aa  134  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.18 
 
 
1868 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.99 
 
 
677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 
1367 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.3 
 
 
1163 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  32.67 
 
 
781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  38.46 
 
 
298 aa  132  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  35.34 
 
 
269 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  39.24 
 
 
603 aa  132  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.02 
 
 
1196 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 
882 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.24 
 
 
1213 aa  131  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.7 
 
 
925 aa  131  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  35.22 
 
 
344 aa  131  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  35.04 
 
 
740 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.39 
 
 
1221 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  31.93 
 
 
538 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 
637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  35.71 
 
 
636 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  32.65 
 
 
426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.79 
 
 
1267 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
621 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1489  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 
261 aa  129  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000202441  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.33 
 
 
1364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.5 
 
 
1190 aa  128  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  38.96 
 
 
1357 aa  128  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.09 
 
 
1454 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  34.94 
 
 
877 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.67 
 
 
1523 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  35.25 
 
 
802 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.37 
 
 
930 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  36.02 
 
 
657 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.96 
 
 
1247 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.43 
 
 
1188 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  35.41 
 
 
287 aa  125  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.92 
 
 
1214 aa  125  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  36.44 
 
 
654 aa  125  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  31.97 
 
 
351 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 
453 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.48 
 
 
1686 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 
1760 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.17 
 
 
1474 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.86 
 
 
576 aa  124  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.79 
 
 
1510 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.32 
 
 
676 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  30.53 
 
 
1104 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  31.6 
 
 
1411 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.68 
 
 
1236 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  34.91 
 
 
305 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.93 
 
 
1211 aa  121  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.18 
 
 
675 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.19 
 
 
742 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.41 
 
 
584 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.89 
 
 
443 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 
623 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.28 
 
 
1481 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  33.21 
 
 
413 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>