More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3768 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  50.46 
 
 		 882 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  48.87 
 
 		 570 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  49.61 
 
 		 535 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  44.21 
 
 		 892 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  45.3 
 
 		 781 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  47.01 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  41.37 
 
 		 1911 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  45.83 
 
 		 929 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  48.15 
 
 		 603 aa  198  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  46.26 
 
 		 522 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  44.17 
 
 		 820 aa  195  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  43.16 
 
 		 621 aa  195  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  47.22 
 
 		 636 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  43.67 
 
 		 593 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  43.59 
 
 		 620 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 625 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  43.59 
 
 		 637 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  42.91 
 
 		 740 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 		 618 aa  188  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  43.61 
 
 		 925 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  43.04 
 
 		 802 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  42.62 
 
 		 877 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  44.26 
 
 		 269 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 617 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  41.6 
 
 		 527 aa  179  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  38.35 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  38.8 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  41.67 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  40.98 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  40.2 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  42.4 
 
 		 616 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  44 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  45 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  42.49 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  37.84 
 
 		 654 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1196 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  44.65 
 
 		 523 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  42.4 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  42.08 
 
 		 620 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  39.49 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  41.37 
 
 		 654 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  39.27 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  40.96 
 
 		 657 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  43.46 
 
 		 616 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  40.56 
 
 		 862 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  39.16 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 1104 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  39.54 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  34.86 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  41.42 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  38.91 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  40.3 
 
 		 586 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  40.98 
 
 		 751 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  37.41 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  42.27 
 
 		 637 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  39 
 
 		 538 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 639 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 639 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  41.2 
 
 		 664 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  40.82 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  42.26 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  40.89 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  40 
 
 		 491 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  40.39 
 
 		 623 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  40.35 
 
 		 497 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  39.42 
 
 		 346 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.3 
 
 		 416 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  37.97 
 
 		 826 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34 
 
 		 586 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 		 611 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 		 698 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  34.6 
 
 		 433 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  39.66 
 
 		 611 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  38.52 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  39.5 
 
 		 587 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  37.67 
 
 		 600 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  38.49 
 
 		 398 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  36.53 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  37.67 
 
 		 549 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  35.61 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  40.4 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  33.96 
 
 		 584 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  34.07 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  35.22 
 
 		 453 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  37.96 
 
 		 1132 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  37.79 
 
 		 517 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 398 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  35.79 
 
 		 829 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  35.34 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  38.56 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  36.79 
 
 		 556 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  34.01 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  34.01 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  32.11 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  47.89 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 		 628 aa  136  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  36.7 
 
 		 517 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  33.98 
 
 		 742 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>