More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2124 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 698 aa  1391    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  65.49 
 
 		 611 aa  359  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  59.7 
 
 		 626 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  59.33 
 
 		 615 aa  300  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  60.38 
 
 		 609 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2349  serine/threonine protein kinase  53.65 
 
 		 616 aa  290  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.769925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  50 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  50.21 
 
 		 654 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  48.94 
 
 		 616 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  49.36 
 
 		 657 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  47.11 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  47.52 
 
 		 497 aa  226  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  45.64 
 
 		 523 aa  213  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  44.9 
 
 		 570 aa  207  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  44.54 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  42.08 
 
 		 427 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  42.08 
 
 		 424 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  41.7 
 
 		 423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  42.22 
 
 		 291 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  40.34 
 
 		 292 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  36.65 
 
 		 668 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 668 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  41.45 
 
 		 277 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  33.78 
 
 		 603 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  36.74 
 
 		 282 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  37.6 
 
 		 288 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  38.24 
 
 		 301 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  37.69 
 
 		 284 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  35.56 
 
 		 346 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  36.48 
 
 		 781 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  37.21 
 
 		 283 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.3 
 
 		 925 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  42.47 
 
 		 289 aa  150  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1911 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  36.36 
 
 		 522 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  32.06 
 
 		 416 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  37.6 
 
 		 892 aa  147  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  35.47 
 
 		 293 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.24 
 
 		 820 aa  147  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  37.3 
 
 		 538 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  38.1 
 
 		 358 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  35.65 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.91 
 
 		 716 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  38.36 
 
 		 636 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  34.93 
 
 		 802 aa  144  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  36.19 
 
 		 286 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2441  protein kinase  36.26 
 
 		 701 aa  143  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77399  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  37.87 
 
 		 351 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 		 616 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  34.72 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  36.06 
 
 		 292 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  36.55 
 
 		 269 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  32.54 
 
 		 952 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 637 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.41 
 
 		 654 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.46 
 
 		 687 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  35.57 
 
 		 338 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  37.02 
 
 		 620 aa  140  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  36.2 
 
 		 621 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  35.09 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.49 
 
 		 618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.78 
 
 		 614 aa  138  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 		 625 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  36.77 
 
 		 882 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 620 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  36.99 
 
 		 740 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  34.8 
 
 		 281 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  36 
 
 		 527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  34.26 
 
 		 593 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  41.12 
 
 		 517 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  24.97 
 
 		 715 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 		 538 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 820 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1196 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.04 
 
 		 628 aa  134  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  33.59 
 
 		 638 aa  134  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  35.9 
 
 		 862 aa  133  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 		 559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  34.8 
 
 		 240 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  37.23 
 
 		 877 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 		 618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 		 680 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  32.85 
 
 		 556 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  34.8 
 
 		 1132 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  34.56 
 
 		 929 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 		 1289 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.63 
 
 		 591 aa  130  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 646 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  34.8 
 
 		 664 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.98 
 
 		 700 aa  129  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 763 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 623 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 870 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  34.48 
 
 		 287 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 541 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>