More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1451 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  100 
 
 
952 aa  1947    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  48.66 
 
 
446 aa  223  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  44.44 
 
 
282 aa  196  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  37.17 
 
 
922 aa  195  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  41.3 
 
 
279 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  43.11 
 
 
276 aa  187  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  45.06 
 
 
263 aa  183  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 
715 aa  160  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
616 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  41.13 
 
 
475 aa  157  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 
554 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  40.08 
 
 
603 aa  157  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  35.34 
 
 
636 aa  155  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  39.59 
 
 
587 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
625 aa  152  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  36.78 
 
 
346 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  34.83 
 
 
538 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
882 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  36.11 
 
 
296 aa  149  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  37.61 
 
 
358 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  33.44 
 
 
620 aa  148  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  36.43 
 
 
1911 aa  148  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
620 aa  147  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.39 
 
 
654 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
621 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  36.03 
 
 
416 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  33.33 
 
 
586 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  38.14 
 
 
781 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  34.9 
 
 
892 aa  141  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
637 aa  141  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 
698 aa  141  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.14 
 
 
925 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 
637 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  37.04 
 
 
267 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  35.41 
 
 
527 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  34.43 
 
 
262 aa  138  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  35.61 
 
 
862 aa  138  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  32.19 
 
 
1132 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.66 
 
 
1196 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
617 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.17 
 
 
820 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  35.6 
 
 
488 aa  137  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  33.7 
 
 
287 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  36.33 
 
 
426 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  39.91 
 
 
611 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 
351 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  35.6 
 
 
254 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  30.22 
 
 
664 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  31.43 
 
 
491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
618 aa  134  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  31.62 
 
 
802 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  31.87 
 
 
453 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  34.51 
 
 
616 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  30.87 
 
 
348 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  34.5 
 
 
522 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  30.87 
 
 
348 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  32.79 
 
 
657 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  34.54 
 
 
877 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  32.79 
 
 
654 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.83 
 
 
293 aa  129  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  32.89 
 
 
413 aa  128  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  34.1 
 
 
287 aa  128  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  33.93 
 
 
298 aa  127  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  32.59 
 
 
294 aa  127  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  32.34 
 
 
288 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.6 
 
 
584 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  29.93 
 
 
390 aa  127  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  35.04 
 
 
929 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.92 
 
 
517 aa  126  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  34.44 
 
 
740 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.25 
 
 
267 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  33.82 
 
 
497 aa  125  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  35.56 
 
 
336 aa  124  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 
639 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 
639 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  33.98 
 
 
1104 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  34.89 
 
 
269 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  32.8 
 
 
292 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  32.8 
 
 
292 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 
509 aa  121  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.77 
 
 
398 aa  121  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  34.41 
 
 
281 aa  121  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 
570 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  34.3 
 
 
305 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 
611 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  35.19 
 
 
285 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
555 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  34.58 
 
 
768 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  33.62 
 
 
668 aa  117  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.34 
 
 
325 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
623 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  32.91 
 
 
523 aa  115  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  31.06 
 
 
291 aa  115  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 
398 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  30.14 
 
 
292 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  30.86 
 
 
826 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.36 
 
 
277 aa  112  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.8 
 
 
535 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.48 
 
 
751 aa  111  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>