More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3119 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  97.01 
 
 
668 aa  1168    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  100 
 
 
668 aa  1305    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2441  protein kinase  48.43 
 
 
701 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77399  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
698 aa  167  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  38.34 
 
 
615 aa  157  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2349  serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 
616 aa  156  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.769925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
609 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  35 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
626 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
427 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  34.8 
 
 
424 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 
611 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
763 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.81 
 
 
627 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.77 
 
 
1044 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.55 
 
 
715 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 
894 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.42 
 
 
584 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.97 
 
 
591 aa  125  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.26 
 
 
607 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.49 
 
 
593 aa  124  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
1289 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
707 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
888 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
1383 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  34.64 
 
 
615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.59 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.09 
 
 
661 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 
1415 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
613 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.48 
 
 
943 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.65 
 
 
676 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.09 
 
 
602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
646 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
604 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.33 
 
 
625 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 
1403 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
642 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.56 
 
 
662 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
563 aa  118  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 
608 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 
673 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.82 
 
 
692 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
703 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.47 
 
 
553 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.27 
 
 
642 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
600 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.74 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1554  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0554404  normal  0.189627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3472  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.66 
 
 
614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.45 
 
 
647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.08 
 
 
621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1553  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  32.37 
 
 
658 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
622 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
691 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
647 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 
783 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4246  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
623 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.69 
 
 
598 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  33.94 
 
 
1108 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
611 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 
729 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  33.21 
 
 
1053 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
776 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  31.67 
 
 
565 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.68 
 
 
650 aa  114  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.94 
 
 
635 aa  114  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.23 
 
 
841 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4096  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
663 aa  114  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.79 
 
 
668 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4988  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
773 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0218503  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4863  Serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00126679  unclonable  0.000000230163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 
820 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4221  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 
623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
471 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
1422 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  29.89 
 
 
399 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.68 
 
 
652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
568 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.36 
 
 
687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.68 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 
581 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
421 aa  112  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
891 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
569 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
666 aa  112  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
646 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  32.54 
 
 
1358 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
559 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  31.82 
 
 
1057 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>