More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2441 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2441  protein kinase  100 
 
 		 701 aa  1353    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77399  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  48.43 
 
 		 668 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  48.58 
 
 		 668 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 615 aa  170  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  38.67 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 427 aa  164  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  38.01 
 
 		 424 aa  164  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 		 609 aa  163  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 698 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2349  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 		 616 aa  153  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.769925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 502 aa  138  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  38.53 
 
 		 1044 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 673 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3472  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 		 407 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.96 
 
 		 627 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 		 1403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 776 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.67 
 
 		 602 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 763 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  31.36 
 
 		 638 aa  127  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.6 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.02 
 
 		 553 aa  125  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.64 
 
 		 579 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.56 
 
 		 662 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 565 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 1383 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.11 
 
 		 1053 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  36.58 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 613 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.19 
 
 		 655 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.58 
 
 		 715 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 651 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 646 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.24 
 
 		 880 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.35 
 
 		 593 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  33.1 
 
 		 1057 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.81 
 
 		 591 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.81 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 		 581 aa  119  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 703 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.11 
 
 		 667 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 		 468 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.95 
 
 		 621 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 641 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 610 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.36 
 
 		 607 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 		 746 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.24 
 
 		 625 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 650 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  29.83 
 
 		 691 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 695 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 		 683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 		 612 aa  116  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.05 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 707 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 610 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.09 
 
 		 652 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  34.22 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 		 985 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.81 
 
 		 666 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 		 894 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 		 614 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.03 
 
 		 627 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0290  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 		 453 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 647 aa  114  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.61 
 
 		 661 aa  114  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 552 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 636 aa  114  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 653 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 666 aa  114  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  36.62 
 
 		 620 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 		 982 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  35.24 
 
 		 1415 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  36.77 
 
 		 563 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.09 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  31.58 
 
 		 565 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.08 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 723 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  37.39 
 
 		 870 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 		 761 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  34.42 
 
 		 623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  32.24 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 		 645 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 		 538 aa  112  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 612 aa  112  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 		 678 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 		 622 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4096  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 		 663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 		 888 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4246  serine/threonine protein kinase  38.07 
 
 		 623 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35051  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 761 aa  111  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 		 541 aa  111  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.79 
 
 		 584 aa  111  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4221  serine/threonine protein kinase  38.07 
 
 		 623 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 601 aa  111  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>