More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5408 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
622 aa  1250    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  46.74 
 
 
527 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  60.15 
 
 
1108 aa  307  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  55.43 
 
 
574 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  55.68 
 
 
586 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  55.76 
 
 
1358 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  55.64 
 
 
626 aa  293  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  56.62 
 
 
583 aa  293  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  56.23 
 
 
561 aa  293  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  58.82 
 
 
484 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  57.52 
 
 
541 aa  283  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  45.45 
 
 
664 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  59.07 
 
 
486 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  50.47 
 
 
566 aa  273  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  56.98 
 
 
604 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  56.98 
 
 
604 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  56.98 
 
 
604 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3400  serine/threonine protein kinase  57.36 
 
 
522 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3463  protein kinase  57.36 
 
 
522 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0363324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3411  protein kinase  57.36 
 
 
522 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  54.48 
 
 
659 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  53.64 
 
 
530 aa  264  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  54.44 
 
 
518 aa  250  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  42.81 
 
 
519 aa  230  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  46.29 
 
 
349 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  43.22 
 
 
618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.12 
 
 
676 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  40.27 
 
 
419 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  47.25 
 
 
776 aa  211  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  41.52 
 
 
615 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  42.18 
 
 
444 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  46.69 
 
 
539 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.75 
 
 
584 aa  206  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  40.65 
 
 
612 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.61 
 
 
916 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.62 
 
 
650 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
746 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  38.38 
 
 
618 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.06 
 
 
880 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.45 
 
 
863 aa  203  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.15 
 
 
681 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.64 
 
 
511 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.77 
 
 
647 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
776 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  43.37 
 
 
673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
377 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  38.19 
 
 
658 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
671 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3472  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
407 aa  196  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 
666 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  40.54 
 
 
626 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.28 
 
 
445 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 
700 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  44.44 
 
 
589 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.9 
 
 
603 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  43.14 
 
 
503 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.52 
 
 
664 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.72 
 
 
594 aa  193  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
382 aa  193  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  40.61 
 
 
758 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41 
 
 
645 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.26 
 
 
668 aa  193  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  41.31 
 
 
624 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  45.38 
 
 
468 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  41.31 
 
 
624 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
559 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  41.31 
 
 
624 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.07 
 
 
613 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.15 
 
 
635 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.21 
 
 
438 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  40.15 
 
 
625 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
790 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  40.15 
 
 
625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.17 
 
 
520 aa  191  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.64 
 
 
627 aa  191  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
557 aa  190  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  37.14 
 
 
609 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.86 
 
 
602 aa  190  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.08 
 
 
598 aa  190  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  38.65 
 
 
621 aa  190  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  40.29 
 
 
617 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.11 
 
 
638 aa  190  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  40.53 
 
 
597 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  41.15 
 
 
414 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 
568 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3381  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
289 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
661 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2229  protein kinase  44.24 
 
 
500 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681599  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
569 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  37.95 
 
 
480 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  40.9 
 
 
567 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.91 
 
 
658 aa  188  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  39.41 
 
 
620 aa  188  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
468 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  38.58 
 
 
625 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  39.18 
 
 
692 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.65 
 
 
681 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.12 
 
 
653 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
571 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
582 aa  187  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>