More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2878 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
626 aa  1235    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2349  serine/threonine protein kinase  42.95 
 
 
616 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.769925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  66.41 
 
 
609 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  66.28 
 
 
615 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  66.29 
 
 
611 aa  342  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  59.7 
 
 
698 aa  316  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3134  Serine/threonine protein kinase  43.23 
 
 
427 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3872  protein kinase  43.23 
 
 
424 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0696421  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3418  hypothetical protein  42.48 
 
 
423 aa  190  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  36.6 
 
 
668 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
668 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  38.89 
 
 
593 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.33 
 
 
591 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2441  protein kinase  35.58 
 
 
701 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.77399  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 
316 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.36 
 
 
700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  34.59 
 
 
661 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
468 aa  135  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  41.71 
 
 
763 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  41.71 
 
 
621 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  38.99 
 
 
667 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 
761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.93 
 
 
505 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.97 
 
 
613 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
673 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.93 
 
 
632 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.75 
 
 
584 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
776 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 
604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  35.41 
 
 
721 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.58 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  36.92 
 
 
320 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  37.17 
 
 
604 aa  128  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 
632 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.81 
 
 
681 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.32 
 
 
664 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  35.19 
 
 
625 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.43 
 
 
635 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  34.17 
 
 
597 aa  127  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 
1422 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.08 
 
 
579 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
568 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  38.99 
 
 
517 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.46 
 
 
650 aa  127  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
678 aa  127  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  35.86 
 
 
625 aa  127  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  40.55 
 
 
618 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
707 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
1289 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
596 aa  126  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.79 
 
 
693 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
450 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
646 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
676 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0023  protein kinase  41.9 
 
 
481 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.39 
 
 
668 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  34.93 
 
 
565 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  33 
 
 
668 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.61 
 
 
647 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  34.81 
 
 
625 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.65 
 
 
503 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  37.27 
 
 
554 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
862 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
647 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.81 
 
 
681 aa  124  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  32.59 
 
 
462 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  34.32 
 
 
586 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3472  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
407 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
651 aa  124  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
502 aa  124  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1394  serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 
501 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.860745  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
1383 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  32.84 
 
 
626 aa  124  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.06 
 
 
603 aa  124  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
716 aa  123  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0957  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 
523 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
700 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 
615 aa  123  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 
503 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.56 
 
 
641 aa  123  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
691 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
624 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 
450 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.07 
 
 
620 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
691 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
624 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
624 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  34.31 
 
 
623 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  37.87 
 
 
614 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.09 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.84 
 
 
601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1096  serine/threonine protein kinase  33.92 
 
 
413 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.4 
 
 
562 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  32.5 
 
 
583 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.39 
 
 
1655 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.92 
 
 
518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>