More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1894 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 523 aa  1041    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  46.22 
 
 		 535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  43.28 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  50 
 
 		 413 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  49.79 
 
 		 657 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  49.79 
 
 		 654 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  48.97 
 
 		 616 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.55 
 
 		 554 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  45.64 
 
 		 698 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  48.1 
 
 		 611 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  41.81 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  44.94 
 
 		 527 aa  203  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.98 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.72 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  46.09 
 
 		 292 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  43.97 
 
 		 497 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.72 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  43.86 
 
 		 518 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.36 
 
 		 292 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.75 
 
 		 474 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  42.12 
 
 		 291 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  42.49 
 
 		 287 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.44 
 
 		 295 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.41 
 
 		 522 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  44.03 
 
 		 277 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.09 
 
 		 289 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  45.49 
 
 		 289 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.53 
 
 		 291 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.41 
 
 		 291 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  41.57 
 
 		 292 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  41.95 
 
 		 301 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 		 617 aa  167  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  38.83 
 
 		 303 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 		 553 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.12 
 
 		 288 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  38.93 
 
 		 282 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  38.2 
 
 		 586 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  39.77 
 
 		 284 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  41.13 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  39.46 
 
 		 288 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  43.1 
 
 		 358 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  39.02 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  39.47 
 
 		 286 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  42.31 
 
 		 240 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  39.75 
 
 		 620 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 		 616 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  37.67 
 
 		 338 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 287 aa  150  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  39.74 
 
 		 416 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  41.63 
 
 		 269 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.9 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 		 637 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  39.67 
 
 		 603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  37.6 
 
 		 802 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  38.91 
 
 		 637 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 882 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  36.7 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.17 
 
 		 820 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  40.42 
 
 		 636 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  38.37 
 
 		 925 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 620 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  42.41 
 
 		 351 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  36.39 
 
 		 628 aa  144  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  36.93 
 
 		 346 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  39.26 
 
 		 740 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  38.43 
 
 		 781 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  38.56 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  27.41 
 
 		 664 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  35.83 
 
 		 1911 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  39.17 
 
 		 621 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  36.61 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  36.36 
 
 		 600 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  36.25 
 
 		 527 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  37.87 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  39.17 
 
 		 593 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  36.67 
 
 		 287 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  36.86 
 
 		 892 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  36.36 
 
 		 929 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 		 625 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  38.93 
 
 		 877 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  34.73 
 
 		 538 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  37.64 
 
 		 293 aa  133  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  37.2 
 
 		 862 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.87 
 
 		 654 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  37.72 
 
 		 292 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  37.75 
 
 		 246 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 		 618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  37.97 
 
 		 668 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  37.99 
 
 		 623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  37.34 
 
 		 336 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  36.84 
 
 		 281 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.21 
 
 		 325 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 		 1104 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.06 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  36.54 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  35.39 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  38.1 
 
 		 1132 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  36.17 
 
 		 267 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  34.13 
 
 		 292 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>