109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1080 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
502 aa  1025    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  57.89 
 
 
554 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.67 
 
 
489 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.66 
 
 
490 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  46.75 
 
 
449 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  44.44 
 
 
276 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  47.3 
 
 
421 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  36.54 
 
 
576 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  43.44 
 
 
499 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.17 
 
 
472 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.91 
 
 
481 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.49 
 
 
445 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.04 
 
 
515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.17 
 
 
478 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
486 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.49 
 
 
485 aa  181  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.36 
 
 
528 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.64 
 
 
485 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  43.86 
 
 
486 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.04 
 
 
541 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.26 
 
 
860 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.4 
 
 
859 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  39.47 
 
 
477 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  37.7 
 
 
518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.26 
 
 
839 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.3 
 
 
778 aa  163  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.9 
 
 
504 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  38.05 
 
 
527 aa  162  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  34.67 
 
 
971 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.05 
 
 
718 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.6 
 
 
649 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 
971 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.81 
 
 
291 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  40.52 
 
 
619 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.89 
 
 
522 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.05 
 
 
713 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.34 
 
 
291 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.36 
 
 
818 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.67 
 
 
479 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.77 
 
 
784 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.77 
 
 
708 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.95 
 
 
474 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.97 
 
 
1155 aa  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.84 
 
 
289 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.84 
 
 
728 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.1 
 
 
295 aa  150  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.23 
 
 
1056 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.61 
 
 
988 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.81 
 
 
680 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.67 
 
 
495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.55 
 
 
1026 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.56 
 
 
288 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.81 
 
 
292 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  37.17 
 
 
523 aa  146  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.02 
 
 
1022 aa  143  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.47 
 
 
1056 aa  143  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  36.36 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
766 aa  137  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.62 
 
 
629 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.17 
 
 
915 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  32.95 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  34.93 
 
 
657 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.96 
 
 
499 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.35 
 
 
553 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.13 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.92 
 
 
862 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  35.4 
 
 
654 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  32.44 
 
 
472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 
502 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.29 
 
 
828 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  33.79 
 
 
616 aa  126  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  31.25 
 
 
798 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.86 
 
 
479 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  33.48 
 
 
570 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  31.84 
 
 
482 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.47 
 
 
824 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  33.93 
 
 
535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
813 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.47 
 
 
776 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.1 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.02 
 
 
652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 
442 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.6 
 
 
397 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.93 
 
 
798 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.66 
 
 
747 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  29.63 
 
 
781 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 
477 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  25.13 
 
 
925 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.25 
 
 
902 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 
654 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  39.44 
 
 
544 aa  50.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 
658 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 
615 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.56 
 
 
652 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2223  FolC bifunctional protein  25.67 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.35 
 
 
590 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 
316 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  29.29 
 
 
325 aa  47  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>