95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3606 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  84.43 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  61.17 
 
 
289 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  62.98 
 
 
287 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  60.34 
 
 
291 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  61.38 
 
 
291 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  56.63 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  59.15 
 
 
528 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  60.09 
 
 
541 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  58.26 
 
 
518 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  55.66 
 
 
504 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  56.16 
 
 
527 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  55.05 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.54 
 
 
522 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  41.85 
 
 
523 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.98 
 
 
553 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
554 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.24 
 
 
502 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  36.49 
 
 
535 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  32.69 
 
 
570 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  32.4 
 
 
576 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  34.22 
 
 
499 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 
481 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.76 
 
 
485 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.35 
 
 
478 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.06 
 
 
515 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 
489 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 
421 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 
486 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.78 
 
 
485 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 
862 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.86 
 
 
445 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.76 
 
 
495 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.53 
 
 
479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 
839 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.7 
 
 
778 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  30.6 
 
 
276 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.35 
 
 
490 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  32.77 
 
 
619 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.29 
 
 
828 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.39 
 
 
680 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  31.19 
 
 
798 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.56 
 
 
859 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.56 
 
 
860 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.8 
 
 
728 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.68 
 
 
499 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.21 
 
 
501 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 
718 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.45 
 
 
713 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.86 
 
 
1026 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  29.22 
 
 
449 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.91 
 
 
988 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.63 
 
 
776 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.07 
 
 
818 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.44 
 
 
629 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  28.39 
 
 
500 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.48 
 
 
915 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.49 
 
 
1056 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 
502 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.96 
 
 
1056 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 
784 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.84 
 
 
824 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.23 
 
 
971 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.86 
 
 
1022 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.23 
 
 
971 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.35 
 
 
1155 aa  92.4  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.65 
 
 
708 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  28.24 
 
 
486 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.67 
 
 
813 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  27.23 
 
 
477 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.52 
 
 
657 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 
766 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 
497 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  28.26 
 
 
472 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.28 
 
 
472 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
649 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  25.33 
 
 
654 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.38 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.06 
 
 
511 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  25.34 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.44 
 
 
652 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.27 
 
 
316 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.3 
 
 
570 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.34 
 
 
658 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  33.58 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 
798 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 
324 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.33 
 
 
477 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  27.86 
 
 
781 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.01 
 
 
652 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  22.68 
 
 
925 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
1557 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>