90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0548 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  100 
 
 		 287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  66.42 
 
 		 289 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  62.98 
 
 		 292 aa  347  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  60.98 
 
 		 291 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  61.19 
 
 		 295 aa  341  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  60 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.76 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  47.15 
 
 		 527 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.05 
 
 		 528 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  52.14 
 
 		 541 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  52.25 
 
 		 518 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.79 
 
 		 474 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.88 
 
 		 504 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.41 
 
 		 522 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.81 
 
 		 553 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  42.6 
 
 		 523 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.94 
 
 		 502 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  36.82 
 
 		 570 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  37.84 
 
 		 535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  31.78 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.78 
 
 		 554 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  34.02 
 
 		 499 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.16 
 
 		 486 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 576 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.09 
 
 		 481 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.22 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 		 515 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.31 
 
 		 478 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 		 489 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.47 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.91 
 
 		 495 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.22 
 
 		 485 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.07 
 
 		 421 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.62 
 
 		 501 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.67 
 
 		 629 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.64 
 
 		 766 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 490 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.78 
 
 		 778 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 		 839 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.35 
 
 		 502 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.26 
 
 		 718 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  31.47 
 
 		 619 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.45 
 
 		 1026 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.13 
 
 		 445 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.95 
 
 		 499 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.6 
 
 		 1022 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.45 
 
 		 862 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.96 
 
 		 824 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.06 
 
 		 860 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  28.76 
 
 		 449 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  29.91 
 
 		 472 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.84 
 
 		 1056 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.64 
 
 		 497 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  30.37 
 
 		 798 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 		 859 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.16 
 
 		 1056 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 776 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.72 
 
 		 988 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 511 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.09 
 
 		 828 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 		 680 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  27.73 
 
 		 500 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 784 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.3 
 
 		 818 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  27.09 
 
 		 971 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 		 971 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.31 
 
 		 728 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.07 
 
 		 1155 aa  82.4  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  27.04 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.07 
 
 		 708 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 		 713 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.43 
 
 		 616 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 649 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 		 915 aa  77  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  27.52 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.8 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  26.61 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  26.1 
 
 		 657 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.64 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  26.23 
 
 		 654 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.38 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.96 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.06 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.35 
 
 		 798 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 		 658 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.62 
 
 		 729 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.9 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>