More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0556 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 554 aa  1152    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.89 
 
 		 502 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 		 523 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  34.15 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.82 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  48.28 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.96 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.02 
 
 		 421 aa  193  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.17 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.56 
 
 		 485 aa  190  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.36 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  41.81 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.92 
 
 		 515 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.1 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.27 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  42.29 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.96 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.63 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  37.74 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.45 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  38.98 
 
 		 971 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.55 
 
 		 971 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.74 
 
 		 486 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  38.87 
 
 		 390 aa  174  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  40.14 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  40.25 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  37.89 
 
 		 296 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  38.36 
 
 		 527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.87 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  40.64 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  36.94 
 
 		 654 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  39.41 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  42.36 
 
 		 657 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  38.54 
 
 		 348 aa  163  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 		 715 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  35.17 
 
 		 952 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  38.21 
 
 		 348 aa  162  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  38.98 
 
 		 509 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.37 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  38.59 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.18 
 
 		 495 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  39.22 
 
 		 636 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.02 
 
 		 1026 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.73 
 
 		 680 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39 
 
 		 479 aa  157  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.7 
 
 		 839 aa  156  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.77 
 
 		 859 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.69 
 
 		 474 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  37.36 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.29 
 
 		 728 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.39 
 
 		 860 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  40.48 
 
 		 282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.66 
 
 		 778 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.81 
 
 		 862 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.17 
 
 		 1155 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  36.12 
 
 		 254 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  39.3 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 		 620 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  38.89 
 
 		 263 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 		 637 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  41.06 
 
 		 279 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.97 
 
 		 293 aa  150  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.42 
 
 		 295 aa  150  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.66 
 
 		 818 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.4 
 
 		 828 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.48 
 
 		 1056 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  35.89 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.73 
 
 		 718 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 		 292 aa  147  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.31 
 
 		 784 aa  147  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.08 
 
 		 915 aa  146  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.27 
 
 		 472 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.44 
 
 		 713 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  34.06 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1911 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.63 
 
 		 708 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 		 291 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.08 
 
 		 776 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.2 
 
 		 1056 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  35.27 
 
 		 798 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.63 
 
 		 988 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.56 
 
 		 291 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.03 
 
 		 603 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.03 
 
 		 649 aa  143  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  36.5 
 
 		 587 aa  143  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  34.51 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  38.96 
 
 		 922 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  38.55 
 
 		 398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.38 
 
 		 499 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 		 276 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.13 
 
 		 325 aa  140  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1262  protein of unknown function DUF323  36.43 
 
 		 276 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.49 
 
 		 289 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.64 
 
 		 824 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.32 
 
 		 1022 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.39 
 
 		 813 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 		 621 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 882 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.18 
 
 		 826 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>