More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3029 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  100 
 
 
527 aa  1052    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  65.61 
 
 
528 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  63.72 
 
 
541 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  59.51 
 
 
474 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.51 
 
 
522 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.78 
 
 
553 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  77.82 
 
 
518 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  70.2 
 
 
504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  56.16 
 
 
292 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  52.68 
 
 
295 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  46.79 
 
 
287 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.66 
 
 
291 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.51 
 
 
291 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.88 
 
 
289 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  47.56 
 
 
288 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  41.98 
 
 
570 aa  193  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  45.87 
 
 
523 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  44.73 
 
 
535 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.36 
 
 
554 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.05 
 
 
502 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.63 
 
 
489 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  36.61 
 
 
576 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.98 
 
 
485 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  36.09 
 
 
499 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.72 
 
 
860 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.99 
 
 
859 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  30.83 
 
 
276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.44 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.29 
 
 
445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 
478 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.33 
 
 
828 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.07 
 
 
501 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 
481 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.84 
 
 
515 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.57 
 
 
680 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.22 
 
 
778 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.19 
 
 
728 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.91 
 
 
472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.22 
 
 
479 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.23 
 
 
495 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 
862 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  31.74 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
490 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 
713 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.17 
 
 
486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.45 
 
 
499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  32.06 
 
 
449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  31.15 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.88 
 
 
915 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
839 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  28.64 
 
 
798 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.17 
 
 
718 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 
1056 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  31.23 
 
 
971 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.23 
 
 
971 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.16 
 
 
629 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.02 
 
 
1026 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  31.95 
 
 
619 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 
818 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.01 
 
 
502 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
1155 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1650  TPR repeat-containing protein  47.14 
 
 
460 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 
988 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  30.38 
 
 
477 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.87 
 
 
776 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.61 
 
 
497 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.38 
 
 
784 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.62 
 
 
1056 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.69 
 
 
708 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  33.06 
 
 
472 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 
421 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.48 
 
 
1022 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.85 
 
 
824 aa  99.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  31.34 
 
 
482 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 
813 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 
766 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.02 
 
 
649 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  29.69 
 
 
657 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.82 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.84 
 
 
820 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.44 
 
 
542 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  28.45 
 
 
654 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
649 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.06 
 
 
511 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  31.09 
 
 
616 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 
219 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.88 
 
 
462 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.87 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  30.43 
 
 
750 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.54 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.96 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>