More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0554 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  65.42 
 
 		 527 aa  643    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  100 
 
 		 518 aa  1027    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  64.18 
 
 		 528 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  58.27 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.73 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  79.56 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  68.4 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  58.26 
 
 		 292 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.26 
 
 		 295 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  52.25 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.58 
 
 		 289 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  48.71 
 
 		 291 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  49.33 
 
 		 291 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.34 
 
 		 522 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  48.43 
 
 		 288 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  41.63 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  35.99 
 
 		 570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.64 
 
 		 502 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 		 554 aa  157  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  35.09 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.6 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.84 
 
 		 489 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  37.02 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  32.48 
 
 		 276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.24 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  35.27 
 
 		 576 aa  130  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.58 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.46 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.61 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.03 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.18 
 
 		 501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.77 
 
 		 499 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.04 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.56 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.29 
 
 		 859 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.2 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 828 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  30.17 
 
 		 449 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.88 
 
 		 629 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 915 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 		 778 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  28.04 
 
 		 500 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 		 680 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 1026 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1650  TPR repeat-containing protein  44.3 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.8 
 
 		 862 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  31.02 
 
 		 619 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.77 
 
 		 728 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.52 
 
 		 713 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 798 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.33 
 
 		 718 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 860 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  31.29 
 
 		 472 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.42 
 
 		 988 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.89 
 
 		 766 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 		 824 aa  96.3  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 1056 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  35.22 
 
 		 462 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.76 
 
 		 1022 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.6 
 
 		 1056 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32 
 
 		 421 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 261 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 		 497 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 649 aa  94  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 		 839 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  34.87 
 
 		 306 aa  93.2  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.8 
 
 		 818 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.78 
 
 		 776 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 		 708 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 784 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  29.26 
 
 		 657 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  26.88 
 
 		 486 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.81 
 
 		 373 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  28.57 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 649 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 240 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.64 
 
 		 820 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 542 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 280 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.54 
 
 		 706 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 286 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.01 
 
 		 706 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 392 aa  87  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  28.19 
 
 		 971 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.18 
 
 		 582 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 1276 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.44 
 
 		 813 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 		 286 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  27.02 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.76 
 
 		 654 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>