102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0572 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
421 aa  864    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  47.3 
 
 
502 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  46.02 
 
 
554 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.64 
 
 
485 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.23 
 
 
489 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.33 
 
 
478 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.74 
 
 
515 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.95 
 
 
485 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  42.92 
 
 
499 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.91 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  38.74 
 
 
576 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  42.13 
 
 
971 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.13 
 
 
971 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.35 
 
 
481 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  39.84 
 
 
486 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.53 
 
 
445 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  39.68 
 
 
477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  41.48 
 
 
449 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  37.24 
 
 
276 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.07 
 
 
818 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 
629 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.75 
 
 
784 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.52 
 
 
988 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.57 
 
 
839 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.65 
 
 
778 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.89 
 
 
718 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.44 
 
 
860 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.68 
 
 
859 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.99 
 
 
713 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  39.46 
 
 
619 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.95 
 
 
649 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.29 
 
 
1056 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.72 
 
 
1022 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.56 
 
 
708 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.84 
 
 
1056 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.45 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.09 
 
 
472 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.78 
 
 
728 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.64 
 
 
680 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.71 
 
 
1155 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.12 
 
 
495 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.22 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  33.88 
 
 
500 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.3 
 
 
501 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 
292 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 
499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  33.78 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 
502 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.84 
 
 
291 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.53 
 
 
1026 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.27 
 
 
766 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.19 
 
 
289 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.91 
 
 
472 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.96 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.27 
 
 
915 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.77 
 
 
497 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.63 
 
 
295 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  36.65 
 
 
482 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.63 
 
 
442 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  31.09 
 
 
654 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  33.79 
 
 
798 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  32.5 
 
 
657 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.4 
 
 
288 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.2 
 
 
397 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.17 
 
 
479 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.07 
 
 
511 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  32.07 
 
 
287 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  31.71 
 
 
527 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.56 
 
 
528 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.09 
 
 
828 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.18 
 
 
862 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.44 
 
 
504 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 
541 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  30 
 
 
616 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.04 
 
 
813 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  32 
 
 
518 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 
776 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.64 
 
 
798 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  29.15 
 
 
535 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.75 
 
 
824 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.69 
 
 
474 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 
522 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32 
 
 
652 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 
570 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  27.02 
 
 
570 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  26.11 
 
 
925 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 
652 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.89 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.37 
 
 
477 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.43 
 
 
658 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 
1687 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  26.78 
 
 
670 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 
324 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 
898 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 
890 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  25.89 
 
 
781 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  24.9 
 
 
654 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 
1557 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>