95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3036 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  84.43 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  61.19 
 
 		 287 aa  341  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  61.29 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  57.73 
 
 		 291 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  58.19 
 
 		 291 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.8 
 
 		 288 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.51 
 
 		 528 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  55.36 
 
 		 541 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  54.26 
 
 		 518 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  53.3 
 
 		 474 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.57 
 
 		 504 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  52.68 
 
 		 527 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.79 
 
 		 522 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.03 
 
 		 553 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  42.92 
 
 		 523 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.42 
 
 		 554 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.22 
 
 		 502 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  31.94 
 
 		 576 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  35.53 
 
 		 499 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  37.22 
 
 		 535 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  36.65 
 
 		 570 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.89 
 
 		 489 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 		 485 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.33 
 
 		 478 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.05 
 
 		 515 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.56 
 
 		 485 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.02 
 
 		 479 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.86 
 
 		 495 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 		 862 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.14 
 
 		 486 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35 
 
 		 445 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.93 
 
 		 828 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  28.99 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  33.06 
 
 		 798 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 		 778 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.9 
 
 		 859 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.63 
 
 		 421 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.74 
 
 		 860 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  32.49 
 
 		 619 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.11 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.43 
 
 		 839 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 		 718 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.04 
 
 		 915 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 		 713 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.37 
 
 		 824 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.49 
 
 		 1026 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  29.68 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.84 
 
 		 680 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.44 
 
 		 1155 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 		 971 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.13 
 
 		 971 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.96 
 
 		 499 aa  99  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 		 766 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.26 
 
 		 813 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.84 
 
 		 728 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 		 776 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.06 
 
 		 501 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  30.87 
 
 		 486 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 		 1056 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 		 708 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 1056 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 		 1022 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  28.12 
 
 		 500 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  31 
 
 		 477 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.91 
 
 		 502 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.33 
 
 		 988 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.32 
 
 		 629 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 818 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.46 
 
 		 472 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.86 
 
 		 784 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  28.7 
 
 		 472 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  25.86 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.04 
 
 		 654 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.59 
 
 		 657 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  27.68 
 
 		 616 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 		 511 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 		 652 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.48 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 		 570 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.57 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 		 442 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.15 
 
 		 477 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  33.58 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 798 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.9 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  27.86 
 
 		 781 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 590 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>